Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Clstn2Q9ER65 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
Clstn2Q9ER65 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Clstn2Q9ER65 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Clstn2Q9ER65 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Clstn2Q9ER65 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Clstn2Q9ER65 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Clstn2Q9ER65 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Clstn2Q9ER65 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Clstn2Q9ER65 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Clstn2Q9ER65 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Clstn2Q9ER65 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Clstn2Q9ER65 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
Clstn2Q9ER65 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Clstn2Q9ER65 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Clstn2Q9ER65 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Clstn2Q9ER65 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Clstn2Q9ER65 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Clstn2Q9ER65 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Clstn2Q9ER65 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Clstn2Q9ER65 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Clstn2Q9ER65 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Clstn2Q9ER65 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
Clstn2Q9ER65 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Clstn2Q9ER65 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Clstn2Q9ER65 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Clstn2Q9ER65 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Clstn2Q9ER65 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Clstn2Q9ER65 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Clstn2Q9ER65 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Clstn2Q9ER65 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Clstn2Q9ER65 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Clstn2Q9ER65 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Clstn2Q9ER65 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Clstn2Q9ER65 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Clstn2Q9ER65 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Clstn2Q9ER65 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Clstn2Q9ER65 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Clstn2Q9ER65 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Clstn2Q9ER65 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
Clstn2Q9ER65 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Clstn2Q9ER65 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Clstn2Q9ER65 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Clstn2Q9ER65 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Clstn2Q9ER65 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Clstn2Q9ER65 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Clstn2Q9ER65 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Clstn2Q9ER65 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Clstn2Q9ER65 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Clstn2Q9ER65 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Clstn2Q9ER65 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Clstn2Q9ER65 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Clstn2Q9ER65 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Clstn2Q9ER65 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Clstn2Q9ER65 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Clstn2Q9ER65 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
Clstn2Q9ER65 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Clstn2Q9ER65 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Clstn2Q9ER65 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Clstn2Q9ER65 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Clstn2Q9ER65 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Clstn2Q9ER65 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Clstn2Q9ER65 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Clstn2Q9ER65 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Clstn2Q9ER65 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Clstn2Q9ER65 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Clstn2Q9ER65 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
Clstn2Q9ER65 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Clstn2Q9ER65 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Clstn2Q9ER65 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Clstn2Q9ER65 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Clstn2Q9ER65 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Clstn2Q9ER65 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Clstn2Q9ER65 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Clstn2Q9ER65 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
Clstn2Q9ER65 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Clstn2Q9ER65 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Clstn2Q9ER65 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Clstn2Q9ER65 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Clstn2Q9ER65 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Clstn2Q9ER65 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
Clstn2Q9ER65 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Clstn2Q9ER65 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Clstn2Q9ER65 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Clstn2Q9ER65 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Clstn2Q9ER65 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Clstn2Q9ER65 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Clstn2Q9ER65 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Clstn2Q9ER65 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Clstn2Q9ER65 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Clstn2Q9ER65 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Clstn2Q9ER65 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Clstn2Q9ER65 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
Clstn2Q9ER65 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Clstn2Q9ER65 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Clstn2Q9ER65 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Clstn2Q9ER65 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Clstn2Q9ER65 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Clstn2Q9ER65 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Clstn2Q9ER65 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms