Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ0

Suv39h2, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H2, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suv39h2Q9EQQ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Suv39h2Q9EQQ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Suv39h2Q9EQQ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Suv39h2Q9EQQ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Suv39h2Q9EQQ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Suv39h2Q9EQQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Suv39h2Q9EQQ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Suv39h2Q9EQQ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Suv39h2Q9EQQ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Suv39h2Q9EQQ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Suv39h2Q9EQQ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Suv39h2Q9EQQ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Suv39h2Q9EQQ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Suv39h2Q9EQQ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Suv39h2Q9EQQ0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Suv39h2Q9EQQ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Suv39h2Q9EQQ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Suv39h2Q9EQQ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Suv39h2Q9EQQ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Suv39h2Q9EQQ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Suv39h2Q9EQQ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Suv39h2Q9EQQ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Suv39h2Q9EQQ0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Suv39h2Q9EQQ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Suv39h2Q9EQQ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Suv39h2Q9EQQ0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Suv39h2Q9EQQ0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Suv39h2Q9EQQ0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Suv39h2Q9EQQ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Suv39h2Q9EQQ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Suv39h2Q9EQQ0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Suv39h2Q9EQQ0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Suv39h2Q9EQQ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Suv39h2Q9EQQ0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Suv39h2Q9EQQ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Suv39h2Q9EQQ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Suv39h2Q9EQQ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Suv39h2Q9EQQ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Suv39h2Q9EQQ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Suv39h2Q9EQQ0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Suv39h2Q9EQQ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Suv39h2Q9EQQ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Suv39h2Q9EQQ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Suv39h2Q9EQQ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Suv39h2Q9EQQ0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Suv39h2Q9EQQ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Suv39h2Q9EQQ0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Suv39h2Q9EQQ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Suv39h2Q9EQQ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Suv39h2Q9EQQ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Suv39h2Q9EQQ0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Suv39h2Q9EQQ0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Suv39h2Q9EQQ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Suv39h2Q9EQQ0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Suv39h2Q9EQQ0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Suv39h2Q9EQQ0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Suv39h2Q9EQQ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Suv39h2Q9EQQ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Suv39h2Q9EQQ0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Suv39h2Q9EQQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Suv39h2Q9EQQ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Suv39h2Q9EQQ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Suv39h2Q9EQQ0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Suv39h2Q9EQQ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Suv39h2Q9EQQ0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Suv39h2Q9EQQ0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Suv39h2Q9EQQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Suv39h2Q9EQQ0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Suv39h2Q9EQQ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Suv39h2Q9EQQ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Suv39h2Q9EQQ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Suv39h2Q9EQQ0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Suv39h2Q9EQQ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Suv39h2Q9EQQ0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Suv39h2Q9EQQ0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Suv39h2Q9EQQ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Suv39h2Q9EQQ0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Suv39h2Q9EQQ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Suv39h2Q9EQQ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Suv39h2Q9EQQ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Suv39h2Q9EQQ0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Suv39h2Q9EQQ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Suv39h2Q9EQQ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Suv39h2Q9EQQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Suv39h2Q9EQQ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Suv39h2Q9EQQ0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Suv39h2Q9EQQ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Suv39h2Q9EQQ0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Suv39h2Q9EQQ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Suv39h2Q9EQQ0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Suv39h2Q9EQQ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Suv39h2Q9EQQ0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.9 ms