Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ15

Gnb1l, Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein 1, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1lQ9EQ15 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnb1lQ9EQ15 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gnb1lQ9EQ15 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gnb1lQ9EQ15 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gnb1lQ9EQ15 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gnb1lQ9EQ15 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gnb1lQ9EQ15 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gnb1lQ9EQ15 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gnb1lQ9EQ15 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gnb1lQ9EQ15 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gnb1lQ9EQ15 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnb1lQ9EQ15 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gnb1lQ9EQ15 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gnb1lQ9EQ15 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gnb1lQ9EQ15 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gnb1lQ9EQ15 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gnb1lQ9EQ15 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnb1lQ9EQ15 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gnb1lQ9EQ15 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gnb1lQ9EQ15 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gnb1lQ9EQ15 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gnb1lQ9EQ15 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gnb1lQ9EQ15 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gnb1lQ9EQ15 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gnb1lQ9EQ15 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gnb1lQ9EQ15 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnb1lQ9EQ15 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gnb1lQ9EQ15 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gnb1lQ9EQ15 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnb1lQ9EQ15 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gnb1lQ9EQ15 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gnb1lQ9EQ15 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gnb1lQ9EQ15 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gnb1lQ9EQ15 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gnb1lQ9EQ15 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gnb1lQ9EQ15 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gnb1lQ9EQ15 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gnb1lQ9EQ15 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gnb1lQ9EQ15 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gnb1lQ9EQ15 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gnb1lQ9EQ15 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gnb1lQ9EQ15 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gnb1lQ9EQ15 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gnb1lQ9EQ15 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gnb1lQ9EQ15 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gnb1lQ9EQ15 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gnb1lQ9EQ15 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gnb1lQ9EQ15 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gnb1lQ9EQ15 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gnb1lQ9EQ15 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gnb1lQ9EQ15 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gnb1lQ9EQ15 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gnb1lQ9EQ15 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gnb1lQ9EQ15 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gnb1lQ9EQ15 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gnb1lQ9EQ15 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnb1lQ9EQ15 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnb1lQ9EQ15 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnb1lQ9EQ15 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnb1lQ9EQ15 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnb1lQ9EQ15 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnb1lQ9EQ15 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gnb1lQ9EQ15 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gnb1lQ9EQ15 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms