Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ06

Hsd17b11, Estradiol 17-beta-dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsd17b11Q9EQ06 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hsd17b11Q9EQ06 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hsd17b11Q9EQ06 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hsd17b11Q9EQ06 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hsd17b11Q9EQ06 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hsd17b11Q9EQ06 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hsd17b11Q9EQ06 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hsd17b11Q9EQ06 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hsd17b11Q9EQ06 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hsd17b11Q9EQ06 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hsd17b11Q9EQ06 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hsd17b11Q9EQ06 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hsd17b11Q9EQ06 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hsd17b11Q9EQ06 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hsd17b11Q9EQ06 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hsd17b11Q9EQ06 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hsd17b11Q9EQ06 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hsd17b11Q9EQ06 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hsd17b11Q9EQ06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hsd17b11Q9EQ06 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hsd17b11Q9EQ06 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hsd17b11Q9EQ06 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hsd17b11Q9EQ06 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hsd17b11Q9EQ06 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hsd17b11Q9EQ06 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hsd17b11Q9EQ06 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hsd17b11Q9EQ06 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hsd17b11Q9EQ06 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hsd17b11Q9EQ06 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hsd17b11Q9EQ06 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hsd17b11Q9EQ06 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hsd17b11Q9EQ06 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hsd17b11Q9EQ06 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hsd17b11Q9EQ06 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hsd17b11Q9EQ06 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hsd17b11Q9EQ06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hsd17b11Q9EQ06 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hsd17b11Q9EQ06 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hsd17b11Q9EQ06 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hsd17b11Q9EQ06 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hsd17b11Q9EQ06 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hsd17b11Q9EQ06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hsd17b11Q9EQ06 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hsd17b11Q9EQ06 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hsd17b11Q9EQ06 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hsd17b11Q9EQ06 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hsd17b11Q9EQ06 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hsd17b11Q9EQ06 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hsd17b11Q9EQ06 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hsd17b11Q9EQ06 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hsd17b11Q9EQ06 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hsd17b11Q9EQ06 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hsd17b11Q9EQ06 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hsd17b11Q9EQ06 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hsd17b11Q9EQ06 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hsd17b11Q9EQ06 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 479.4 ms