Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan4Q9DCK3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan4Q9DCK3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan4Q9DCK3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan4Q9DCK3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan4Q9DCK3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan4Q9DCK3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan4Q9DCK3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan4Q9DCK3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan4Q9DCK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan4Q9DCK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan4Q9DCK3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan4Q9DCK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan4Q9DCK3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan4Q9DCK3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan4Q9DCK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan4Q9DCK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan4Q9DCK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan4Q9DCK3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan4Q9DCK3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan4Q9DCK3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan4Q9DCK3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan4Q9DCK3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan4Q9DCK3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan4Q9DCK3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan4Q9DCK3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan4Q9DCK3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan4Q9DCK3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan4Q9DCK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan4Q9DCK3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan4Q9DCK3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan4Q9DCK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan4Q9DCK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan4Q9DCK3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan4Q9DCK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan4Q9DCK3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan4Q9DCK3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan4Q9DCK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan4Q9DCK3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan4Q9DCK3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan4Q9DCK3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan4Q9DCK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan4Q9DCK3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan4Q9DCK3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan4Q9DCK3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan4Q9DCK3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan4Q9DCK3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan4Q9DCK3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan4Q9DCK3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan4Q9DCK3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan4Q9DCK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan4Q9DCK3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan4Q9DCK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan4Q9DCK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan4Q9DCK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan4Q9DCK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tspan4Q9DCK3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tspan4Q9DCK3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan4Q9DCK3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tspan4Q9DCK3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tspan4Q9DCK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tspan4Q9DCK3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tspan4Q9DCK3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tspan4Q9DCK3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tspan4Q9DCK3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tspan4Q9DCK3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tspan4Q9DCK3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan4Q9DCK3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tspan4Q9DCK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tspan4Q9DCK3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tspan4Q9DCK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tspan4Q9DCK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan4Q9DCK3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms