Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem239Q9DA47 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem239Q9DA47 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem239Q9DA47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem239Q9DA47 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem239Q9DA47 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem239Q9DA47 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem239Q9DA47 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem239Q9DA47 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem239Q9DA47 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem239Q9DA47 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem239Q9DA47 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem239Q9DA47 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem239Q9DA47 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem239Q9DA47 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem239Q9DA47 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem239Q9DA47 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem239Q9DA47 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem239Q9DA47 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem239Q9DA47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem239Q9DA47 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem239Q9DA47 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem239Q9DA47 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem239Q9DA47 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem239Q9DA47 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem239Q9DA47 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem239Q9DA47 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem239Q9DA47 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem239Q9DA47 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem239Q9DA47 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem239Q9DA47 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem239Q9DA47 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem239Q9DA47 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem239Q9DA47 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tmem239Q9DA47 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem239Q9DA47 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem239Q9DA47 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem239Q9DA47 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem239Q9DA47 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem239Q9DA47 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem239Q9DA47 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem239Q9DA47 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem239Q9DA47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem239Q9DA47 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem239Q9DA47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem239Q9DA47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem239Q9DA47 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem239Q9DA47 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem239Q9DA47 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem239Q9DA47 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem239Q9DA47 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem239Q9DA47 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem239Q9DA47 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmem239Q9DA47 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem239Q9DA47 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem239Q9DA47 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem239Q9DA47 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem239Q9DA47 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem239Q9DA47 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem239Q9DA47 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem239Q9DA47 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem239Q9DA47 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem239Q9DA47 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem239Q9DA47 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem239Q9DA47 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem239Q9DA47 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem239Q9DA47 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem239Q9DA47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem239Q9DA47 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem239Q9DA47 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem239Q9DA47 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem239Q9DA47 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem239Q9DA47 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem239Q9DA47 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem239Q9DA47 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem239Q9DA47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem239Q9DA47 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem239Q9DA47 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem239Q9DA47 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem239Q9DA47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem239Q9DA47 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem239Q9DA47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem239Q9DA47 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms