Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Tspan13Q9D8C2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan13Q9D8C2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Tspan13Q9D8C2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
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Tspan13Q9D8C2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan13Q9D8C2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Tspan13Q9D8C2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Tspan13Q9D8C2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan13Q9D8C2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan13Q9D8C2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan13Q9D8C2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan13Q9D8C2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan13Q9D8C2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan13Q9D8C2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan13Q9D8C2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan13Q9D8C2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan13Q9D8C2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tspan13Q9D8C2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tspan13Q9D8C2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tspan13Q9D8C2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tspan13Q9D8C2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan13Q9D8C2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tspan13Q9D8C2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Tspan13Q9D8C2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan13Q9D8C2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan13Q9D8C2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan13Q9D8C2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan13Q9D8C2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tspan13Q9D8C2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tspan13Q9D8C2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Tspan13Q9D8C2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tspan13Q9D8C2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan13Q9D8C2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Tspan13Q9D8C2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Tspan13Q9D8C2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan13Q9D8C2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Tspan13Q9D8C2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan13Q9D8C2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan13Q9D8C2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan13Q9D8C2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tspan13Q9D8C2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tspan13Q9D8C2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Tspan13Q9D8C2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tspan13Q9D8C2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan13Q9D8C2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tspan13Q9D8C2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan13Q9D8C2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan13Q9D8C2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tspan13Q9D8C2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan13Q9D8C2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tspan13Q9D8C2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tspan13Q9D8C2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tspan13Q9D8C2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Tspan13Q9D8C2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tspan13Q9D8C2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tspan13Q9D8C2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tspan13Q9D8C2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms