Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PudpQ9D5U5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PudpQ9D5U5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PudpQ9D5U5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PudpQ9D5U5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PudpQ9D5U5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PudpQ9D5U5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PudpQ9D5U5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PudpQ9D5U5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PudpQ9D5U5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PudpQ9D5U5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PudpQ9D5U5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PudpQ9D5U5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PudpQ9D5U5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PudpQ9D5U5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PudpQ9D5U5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PudpQ9D5U5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PudpQ9D5U5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PudpQ9D5U5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PudpQ9D5U5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PudpQ9D5U5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PudpQ9D5U5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PudpQ9D5U5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PudpQ9D5U5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PudpQ9D5U5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PudpQ9D5U5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PudpQ9D5U5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PudpQ9D5U5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PudpQ9D5U5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PudpQ9D5U5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PudpQ9D5U5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PudpQ9D5U5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PudpQ9D5U5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PudpQ9D5U5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PudpQ9D5U5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PudpQ9D5U5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PudpQ9D5U5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PudpQ9D5U5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PudpQ9D5U5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PudpQ9D5U5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PudpQ9D5U5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PudpQ9D5U5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PudpQ9D5U5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PudpQ9D5U5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PudpQ9D5U5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PudpQ9D5U5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PudpQ9D5U5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PudpQ9D5U5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PudpQ9D5U5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PudpQ9D5U5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PudpQ9D5U5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PudpQ9D5U5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PudpQ9D5U5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PudpQ9D5U5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PudpQ9D5U5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PudpQ9D5U5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PudpQ9D5U5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PudpQ9D5U5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PudpQ9D5U5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PudpQ9D5U5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PudpQ9D5U5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PudpQ9D5U5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PudpQ9D5U5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PudpQ9D5U5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PudpQ9D5U5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PudpQ9D5U5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PudpQ9D5U5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PudpQ9D5U5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PudpQ9D5U5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PudpQ9D5U5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PudpQ9D5U5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PudpQ9D5U5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PudpQ9D5U5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PudpQ9D5U5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PudpQ9D5U5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PudpQ9D5U5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PudpQ9D5U5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PudpQ9D5U5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PudpQ9D5U5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PudpQ9D5U5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PudpQ9D5U5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PudpQ9D5U5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PudpQ9D5U5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PudpQ9D5U5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PudpQ9D5U5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PudpQ9D5U5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PudpQ9D5U5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PudpQ9D5U5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PudpQ9D5U5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PudpQ9D5U5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PudpQ9D5U5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms