Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T2

4921524L21Rik, MCG15536, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921524L21RikQ9D5T2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
4921524L21RikQ9D5T2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
4921524L21RikQ9D5T2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
4921524L21RikQ9D5T2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
4921524L21RikQ9D5T2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
4921524L21RikQ9D5T2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
4921524L21RikQ9D5T2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
4921524L21RikQ9D5T2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
4921524L21RikQ9D5T2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
4921524L21RikQ9D5T2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
4921524L21RikQ9D5T2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
4921524L21RikQ9D5T2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
4921524L21RikQ9D5T2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
4921524L21RikQ9D5T2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
4921524L21RikQ9D5T2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
4921524L21RikQ9D5T2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
4921524L21RikQ9D5T2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
4921524L21RikQ9D5T2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
4921524L21RikQ9D5T2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
4921524L21RikQ9D5T2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
4921524L21RikQ9D5T2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
4921524L21RikQ9D5T2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
4921524L21RikQ9D5T2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
4921524L21RikQ9D5T2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
4921524L21RikQ9D5T2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
4921524L21RikQ9D5T2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
4921524L21RikQ9D5T2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
4921524L21RikQ9D5T2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
4921524L21RikQ9D5T2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
4921524L21RikQ9D5T2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
4921524L21RikQ9D5T2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
4921524L21RikQ9D5T2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
4921524L21RikQ9D5T2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
4921524L21RikQ9D5T2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
4921524L21RikQ9D5T2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
4921524L21RikQ9D5T2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
4921524L21RikQ9D5T2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
4921524L21RikQ9D5T2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
4921524L21RikQ9D5T2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
4921524L21RikQ9D5T2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
4921524L21RikQ9D5T2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
4921524L21RikQ9D5T2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
4921524L21RikQ9D5T2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
4921524L21RikQ9D5T2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
4921524L21RikQ9D5T2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
4921524L21RikQ9D5T2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
4921524L21RikQ9D5T2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
4921524L21RikQ9D5T2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
4921524L21RikQ9D5T2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
4921524L21RikQ9D5T2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
4921524L21RikQ9D5T2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
4921524L21RikQ9D5T2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
4921524L21RikQ9D5T2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
4921524L21RikQ9D5T2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
4921524L21RikQ9D5T2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
4921524L21RikQ9D5T2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4921524L21RikQ9D5T2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
4921524L21RikQ9D5T2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
4921524L21RikQ9D5T2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
4921524L21RikQ9D5T2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
4921524L21RikQ9D5T2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
4921524L21RikQ9D5T2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
4921524L21RikQ9D5T2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
4921524L21RikQ9D5T2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
4921524L21RikQ9D5T2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
4921524L21RikQ9D5T2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
4921524L21RikQ9D5T2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
4921524L21RikQ9D5T2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
4921524L21RikQ9D5T2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
4921524L21RikQ9D5T2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
4921524L21RikQ9D5T2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
4921524L21RikQ9D5T2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
4921524L21RikQ9D5T2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
4921524L21RikQ9D5T2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
4921524L21RikQ9D5T2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
4921524L21RikQ9D5T2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
4921524L21RikQ9D5T2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
4921524L21RikQ9D5T2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
4921524L21RikQ9D5T2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
4921524L21RikQ9D5T2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
4921524L21RikQ9D5T2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
4921524L21RikQ9D5T2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
4921524L21RikQ9D5T2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
4921524L21RikQ9D5T2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
4921524L21RikQ9D5T2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
4921524L21RikQ9D5T2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
4921524L21RikQ9D5T2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
4921524L21RikQ9D5T2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
4921524L21RikQ9D5T2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
4921524L21RikQ9D5T2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
4921524L21RikQ9D5T2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
4921524L21RikQ9D5T2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
4921524L21RikQ9D5T2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
4921524L21RikQ9D5T2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
4921524L21RikQ9D5T2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
4921524L21RikQ9D5T2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
4921524L21RikQ9D5T2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
4921524L21RikQ9D5T2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
4921524L21RikQ9D5T2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
4921524L21RikQ9D5T2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms