Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clvs1Q9D4C9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clvs1Q9D4C9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clvs1Q9D4C9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clvs1Q9D4C9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clvs1Q9D4C9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clvs1Q9D4C9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clvs1Q9D4C9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clvs1Q9D4C9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clvs1Q9D4C9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clvs1Q9D4C9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clvs1Q9D4C9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clvs1Q9D4C9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clvs1Q9D4C9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clvs1Q9D4C9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clvs1Q9D4C9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Clvs1Q9D4C9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clvs1Q9D4C9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clvs1Q9D4C9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clvs1Q9D4C9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clvs1Q9D4C9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clvs1Q9D4C9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clvs1Q9D4C9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clvs1Q9D4C9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clvs1Q9D4C9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clvs1Q9D4C9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clvs1Q9D4C9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clvs1Q9D4C9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clvs1Q9D4C9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clvs1Q9D4C9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clvs1Q9D4C9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clvs1Q9D4C9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clvs1Q9D4C9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clvs1Q9D4C9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clvs1Q9D4C9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clvs1Q9D4C9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clvs1Q9D4C9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clvs1Q9D4C9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clvs1Q9D4C9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clvs1Q9D4C9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clvs1Q9D4C9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clvs1Q9D4C9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clvs1Q9D4C9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clvs1Q9D4C9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clvs1Q9D4C9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clvs1Q9D4C9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clvs1Q9D4C9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clvs1Q9D4C9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clvs1Q9D4C9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clvs1Q9D4C9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clvs1Q9D4C9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clvs1Q9D4C9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clvs1Q9D4C9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clvs1Q9D4C9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clvs1Q9D4C9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clvs1Q9D4C9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clvs1Q9D4C9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clvs1Q9D4C9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clvs1Q9D4C9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clvs1Q9D4C9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clvs1Q9D4C9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clvs1Q9D4C9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clvs1Q9D4C9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clvs1Q9D4C9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clvs1Q9D4C9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clvs1Q9D4C9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clvs1Q9D4C9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clvs1Q9D4C9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clvs1Q9D4C9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clvs1Q9D4C9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clvs1Q9D4C9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms