Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y6

Fbxo25, F-box only protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo25Q9D2Y6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo25Q9D2Y6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo25Q9D2Y6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo25Q9D2Y6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo25Q9D2Y6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo25Q9D2Y6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo25Q9D2Y6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo25Q9D2Y6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo25Q9D2Y6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo25Q9D2Y6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fbxo25Q9D2Y6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fbxo25Q9D2Y6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fbxo25Q9D2Y6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo25Q9D2Y6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fbxo25Q9D2Y6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo25Q9D2Y6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fbxo25Q9D2Y6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo25Q9D2Y6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fbxo25Q9D2Y6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo25Q9D2Y6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fbxo25Q9D2Y6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fbxo25Q9D2Y6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fbxo25Q9D2Y6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo25Q9D2Y6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fbxo25Q9D2Y6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo25Q9D2Y6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fbxo25Q9D2Y6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fbxo25Q9D2Y6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fbxo25Q9D2Y6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fbxo25Q9D2Y6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fbxo25Q9D2Y6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fbxo25Q9D2Y6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fbxo25Q9D2Y6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo25Q9D2Y6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo25Q9D2Y6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fbxo25Q9D2Y6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fbxo25Q9D2Y6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fbxo25Q9D2Y6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fbxo25Q9D2Y6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fbxo25Q9D2Y6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo25Q9D2Y6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo25Q9D2Y6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo25Q9D2Y6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo25Q9D2Y6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo25Q9D2Y6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo25Q9D2Y6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo25Q9D2Y6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo25Q9D2Y6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo25Q9D2Y6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo25Q9D2Y6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxo25Q9D2Y6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxo25Q9D2Y6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxo25Q9D2Y6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo25Q9D2Y6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxo25Q9D2Y6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxo25Q9D2Y6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo25Q9D2Y6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxo25Q9D2Y6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxo25Q9D2Y6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo25Q9D2Y6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo25Q9D2Y6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo25Q9D2Y6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo25Q9D2Y6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo25Q9D2Y6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo25Q9D2Y6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo25Q9D2Y6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fbxo25Q9D2Y6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fbxo25Q9D2Y6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fbxo25Q9D2Y6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fbxo25Q9D2Y6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fbxo25Q9D2Y6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fbxo25Q9D2Y6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo25Q9D2Y6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fbxo25Q9D2Y6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fbxo25Q9D2Y6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fbxo25Q9D2Y6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo25Q9D2Y6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo25Q9D2Y6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo25Q9D2Y6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo25Q9D2Y6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo25Q9D2Y6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo25Q9D2Y6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo25Q9D2Y6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms