Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H7

Get4, Golgi to ER traffic protein 4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Get4Q9D1H7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Get4Q9D1H7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Get4Q9D1H7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Get4Q9D1H7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Get4Q9D1H7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Get4Q9D1H7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Get4Q9D1H7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Get4Q9D1H7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Get4Q9D1H7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Get4Q9D1H7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Get4Q9D1H7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Get4Q9D1H7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Get4Q9D1H7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Get4Q9D1H7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Get4Q9D1H7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Get4Q9D1H7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Get4Q9D1H7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Get4Q9D1H7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Get4Q9D1H7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Get4Q9D1H7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Get4Q9D1H7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Get4Q9D1H7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Get4Q9D1H7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Get4Q9D1H7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Get4Q9D1H7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Get4Q9D1H7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Get4Q9D1H7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Get4Q9D1H7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Get4Q9D1H7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Get4Q9D1H7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Get4Q9D1H7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Get4Q9D1H7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Get4Q9D1H7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Get4Q9D1H7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Get4Q9D1H7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Get4Q9D1H7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Get4Q9D1H7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Get4Q9D1H7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Get4Q9D1H7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Get4Q9D1H7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Get4Q9D1H7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Get4Q9D1H7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Get4Q9D1H7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Get4Q9D1H7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Get4Q9D1H7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Get4Q9D1H7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Get4Q9D1H7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Get4Q9D1H7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Get4Q9D1H7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Get4Q9D1H7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Get4Q9D1H7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Get4Q9D1H7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Get4Q9D1H7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Get4Q9D1H7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Get4Q9D1H7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Get4Q9D1H7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Get4Q9D1H7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Get4Q9D1H7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Get4Q9D1H7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Get4Q9D1H7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Get4Q9D1H7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Get4Q9D1H7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Get4Q9D1H7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Get4Q9D1H7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Get4Q9D1H7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Get4Q9D1H7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Get4Q9D1H7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Get4Q9D1H7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Get4Q9D1H7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Get4Q9D1H7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Get4Q9D1H7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Get4Q9D1H7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Get4Q9D1H7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Get4Q9D1H7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Get4Q9D1H7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Get4Q9D1H7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Get4Q9D1H7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Get4Q9D1H7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Get4Q9D1H7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Get4Q9D1H7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Get4Q9D1H7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Get4Q9D1H7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Get4Q9D1H7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Get4Q9D1H7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Get4Q9D1H7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Get4Q9D1H7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Get4Q9D1H7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Get4Q9D1H7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Get4Q9D1H7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Get4Q9D1H7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Get4Q9D1H7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Get4Q9D1H7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Get4Q9D1H7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Get4Q9D1H7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Get4Q9D1H7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Get4Q9D1H7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Get4Q9D1H7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Get4Q9D1H7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Get4Q9D1H7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Get4Q9D1H7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms