Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab1bQ9D1G1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rab1bQ9D1G1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab1bQ9D1G1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab1bQ9D1G1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab1bQ9D1G1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab1bQ9D1G1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab1bQ9D1G1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab1bQ9D1G1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab1bQ9D1G1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab1bQ9D1G1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab1bQ9D1G1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab1bQ9D1G1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab1bQ9D1G1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab1bQ9D1G1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab1bQ9D1G1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab1bQ9D1G1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rab1bQ9D1G1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab1bQ9D1G1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab1bQ9D1G1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab1bQ9D1G1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab1bQ9D1G1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rab1bQ9D1G1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab1bQ9D1G1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rab1bQ9D1G1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab1bQ9D1G1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab1bQ9D1G1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab1bQ9D1G1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rab1bQ9D1G1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab1bQ9D1G1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab1bQ9D1G1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab1bQ9D1G1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab1bQ9D1G1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab1bQ9D1G1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab1bQ9D1G1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab1bQ9D1G1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab1bQ9D1G1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab1bQ9D1G1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab1bQ9D1G1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab1bQ9D1G1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab1bQ9D1G1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab1bQ9D1G1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab1bQ9D1G1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab1bQ9D1G1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab1bQ9D1G1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab1bQ9D1G1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab1bQ9D1G1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab1bQ9D1G1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab1bQ9D1G1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab1bQ9D1G1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab1bQ9D1G1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab1bQ9D1G1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab1bQ9D1G1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab1bQ9D1G1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab1bQ9D1G1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab1bQ9D1G1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab1bQ9D1G1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab1bQ9D1G1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab1bQ9D1G1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab1bQ9D1G1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab1bQ9D1G1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab1bQ9D1G1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab1bQ9D1G1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab1bQ9D1G1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab1bQ9D1G1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab1bQ9D1G1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab1bQ9D1G1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab1bQ9D1G1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab1bQ9D1G1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab1bQ9D1G1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab1bQ9D1G1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab1bQ9D1G1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab1bQ9D1G1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab1bQ9D1G1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab1bQ9D1G1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab1bQ9D1G1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab1bQ9D1G1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab1bQ9D1G1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms