Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA5

Zcchc12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc12Q9CZA5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc12Q9CZA5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc12Q9CZA5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc12Q9CZA5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc12Q9CZA5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc12Q9CZA5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc12Q9CZA5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc12Q9CZA5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc12Q9CZA5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc12Q9CZA5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc12Q9CZA5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Zcchc12Q9CZA5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zcchc12Q9CZA5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zcchc12Q9CZA5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zcchc12Q9CZA5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zcchc12Q9CZA5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zcchc12Q9CZA5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zcchc12Q9CZA5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zcchc12Q9CZA5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zcchc12Q9CZA5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zcchc12Q9CZA5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zcchc12Q9CZA5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zcchc12Q9CZA5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zcchc12Q9CZA5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zcchc12Q9CZA5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zcchc12Q9CZA5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zcchc12Q9CZA5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zcchc12Q9CZA5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zcchc12Q9CZA5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zcchc12Q9CZA5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zcchc12Q9CZA5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zcchc12Q9CZA5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zcchc12Q9CZA5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zcchc12Q9CZA5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zcchc12Q9CZA5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc12Q9CZA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc12Q9CZA5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms