Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubb2bQ9CWF2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tubb2bQ9CWF2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tubb2bQ9CWF2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tubb2bQ9CWF2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tubb2bQ9CWF2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tubb2bQ9CWF2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubb2bQ9CWF2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubb2bQ9CWF2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tubb2bQ9CWF2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tubb2bQ9CWF2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tubb2bQ9CWF2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tubb2bQ9CWF2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tubb2bQ9CWF2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tubb2bQ9CWF2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tubb2bQ9CWF2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tubb2bQ9CWF2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tubb2bQ9CWF2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubb2bQ9CWF2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubb2bQ9CWF2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubb2bQ9CWF2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tubb2bQ9CWF2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tubb2bQ9CWF2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubb2bQ9CWF2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubb2bQ9CWF2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubb2bQ9CWF2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubb2bQ9CWF2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubb2bQ9CWF2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tubb2bQ9CWF2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tubb2bQ9CWF2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubb2bQ9CWF2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tubb2bQ9CWF2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubb2bQ9CWF2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tubb2bQ9CWF2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tubb2bQ9CWF2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tubb2bQ9CWF2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tubb2bQ9CWF2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubb2bQ9CWF2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Tubb2bQ9CWF2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tubb2bQ9CWF2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb2bQ9CWF2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tubb2bQ9CWF2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubb2bQ9CWF2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tubb2bQ9CWF2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubb2bQ9CWF2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubb2bQ9CWF2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tubb2bQ9CWF2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb2bQ9CWF2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb2bQ9CWF2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Tubb2bQ9CWF2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubb2bQ9CWF2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubb2bQ9CWF2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubb2bQ9CWF2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tubb2bQ9CWF2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tubb2bQ9CWF2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubb2bQ9CWF2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubb2bQ9CWF2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubb2bQ9CWF2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubb2bQ9CWF2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubb2bQ9CWF2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubb2bQ9CWF2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubb2bQ9CWF2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubb2bQ9CWF2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubb2bQ9CWF2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubb2bQ9CWF2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tubb2bQ9CWF2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tubb2bQ9CWF2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubb2bQ9CWF2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubb2bQ9CWF2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubb2bQ9CWF2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tubb2bQ9CWF2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubb2bQ9CWF2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubb2bQ9CWF2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tubb2bQ9CWF2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tubb2bQ9CWF2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubb2bQ9CWF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubb2bQ9CWF2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubb2bQ9CWF2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tubb2bQ9CWF2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubb2bQ9CWF2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubb2bQ9CWF2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tubb2bQ9CWF2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tubb2bQ9CWF2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tubb2bQ9CWF2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubb2bQ9CWF2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubb2bQ9CWF2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb2bQ9CWF2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubb2bQ9CWF2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubb2bQ9CWF2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubb2bQ9CWF2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubb2bQ9CWF2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms