Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Atxn3Q9CVD2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Atxn3Q9CVD2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Atxn3Q9CVD2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Atxn3Q9CVD2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Atxn3Q9CVD2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Atxn3Q9CVD2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Atxn3Q9CVD2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Atxn3Q9CVD2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Atxn3Q9CVD2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Atxn3Q9CVD2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Atxn3Q9CVD2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Atxn3Q9CVD2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Atxn3Q9CVD2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Atxn3Q9CVD2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Atxn3Q9CVD2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Atxn3Q9CVD2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Atxn3Q9CVD2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Atxn3Q9CVD2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Atxn3Q9CVD2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Atxn3Q9CVD2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atxn3Q9CVD2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atxn3Q9CVD2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Atxn3Q9CVD2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Atxn3Q9CVD2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Atxn3Q9CVD2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Atxn3Q9CVD2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atxn3Q9CVD2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Atxn3Q9CVD2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Atxn3Q9CVD2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Atxn3Q9CVD2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Atxn3Q9CVD2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Atxn3Q9CVD2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Atxn3Q9CVD2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Atxn3Q9CVD2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Atxn3Q9CVD2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Atxn3Q9CVD2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Atxn3Q9CVD2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Atxn3Q9CVD2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Atxn3Q9CVD2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Atxn3Q9CVD2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Atxn3Q9CVD2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Atxn3Q9CVD2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Atxn3Q9CVD2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Atxn3Q9CVD2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Atxn3Q9CVD2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Atxn3Q9CVD2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Atxn3Q9CVD2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Atxn3Q9CVD2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Atxn3Q9CVD2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Atxn3Q9CVD2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Atxn3Q9CVD2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Atxn3Q9CVD2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Atxn3Q9CVD2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Atxn3Q9CVD2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Atxn3Q9CVD2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Atxn3Q9CVD2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Atxn3Q9CVD2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Atxn3Q9CVD2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Atxn3Q9CVD2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Atxn3Q9CVD2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Atxn3Q9CVD2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Atxn3Q9CVD2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Atxn3Q9CVD2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Atxn3Q9CVD2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Atxn3Q9CVD2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Atxn3Q9CVD2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Atxn3Q9CVD2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Atxn3Q9CVD2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Atxn3Q9CVD2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Atxn3Q9CVD2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Atxn3Q9CVD2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Atxn3Q9CVD2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Atxn3Q9CVD2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Atxn3Q9CVD2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Atxn3Q9CVD2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Atxn3Q9CVD2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Atxn3Q9CVD2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Atxn3Q9CVD2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Atxn3Q9CVD2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Atxn3Q9CVD2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Atxn3Q9CVD2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Atxn3Q9CVD2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Atxn3Q9CVD2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atxn3Q9CVD2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Atxn3Q9CVD2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Atxn3Q9CVD2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Atxn3Q9CVD2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atxn3Q9CVD2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Atxn3Q9CVD2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Atxn3Q9CVD2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Atxn3Q9CVD2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Atxn3Q9CVD2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Atxn3Q9CVD2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Atxn3Q9CVD2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Atxn3Q9CVD2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Atxn3Q9CVD2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Atxn3Q9CVD2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms