Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ5

Prr13, Proline-rich protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr13Q9CQJ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr13Q9CQJ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr13Q9CQJ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr13Q9CQJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr13Q9CQJ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr13Q9CQJ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prr13Q9CQJ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr13Q9CQJ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr13Q9CQJ5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr13Q9CQJ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr13Q9CQJ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prr13Q9CQJ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prr13Q9CQJ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prr13Q9CQJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prr13Q9CQJ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr13Q9CQJ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr13Q9CQJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prr13Q9CQJ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prr13Q9CQJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr13Q9CQJ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prr13Q9CQJ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prr13Q9CQJ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr13Q9CQJ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prr13Q9CQJ5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prr13Q9CQJ5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prr13Q9CQJ5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr13Q9CQJ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr13Q9CQJ5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr13Q9CQJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr13Q9CQJ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr13Q9CQJ5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr13Q9CQJ5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr13Q9CQJ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr13Q9CQJ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr13Q9CQJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prr13Q9CQJ5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prr13Q9CQJ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr13Q9CQJ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prr13Q9CQJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr13Q9CQJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prr13Q9CQJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prr13Q9CQJ5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prr13Q9CQJ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr13Q9CQJ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr13Q9CQJ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prr13Q9CQJ5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr13Q9CQJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prr13Q9CQJ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prr13Q9CQJ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Prr13Q9CQJ5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr13Q9CQJ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prr13Q9CQJ5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prr13Q9CQJ5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prr13Q9CQJ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr13Q9CQJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prr13Q9CQJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prr13Q9CQJ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prr13Q9CQJ5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prr13Q9CQJ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr13Q9CQJ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prr13Q9CQJ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms