Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6v0e1Q9CQD8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp6v0e1Q9CQD8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp6v0e1Q9CQD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp6v0e1Q9CQD8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp6v0e1Q9CQD8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp6v0e1Q9CQD8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp6v0e1Q9CQD8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp6v0e1Q9CQD8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp6v0e1Q9CQD8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atp6v0e1Q9CQD8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atp6v0e1Q9CQD8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp6v0e1Q9CQD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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