Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab5aQ9CQD1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab5aQ9CQD1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab5aQ9CQD1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab5aQ9CQD1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab5aQ9CQD1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab5aQ9CQD1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab5aQ9CQD1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab5aQ9CQD1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab5aQ9CQD1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab5aQ9CQD1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rab5aQ9CQD1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab5aQ9CQD1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab5aQ9CQD1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab5aQ9CQD1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab5aQ9CQD1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab5aQ9CQD1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab5aQ9CQD1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab5aQ9CQD1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab5aQ9CQD1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab5aQ9CQD1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab5aQ9CQD1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab5aQ9CQD1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab5aQ9CQD1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab5aQ9CQD1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab5aQ9CQD1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab5aQ9CQD1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab5aQ9CQD1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab5aQ9CQD1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab5aQ9CQD1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab5aQ9CQD1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab5aQ9CQD1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab5aQ9CQD1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab5aQ9CQD1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab5aQ9CQD1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab5aQ9CQD1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab5aQ9CQD1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab5aQ9CQD1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab5aQ9CQD1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab5aQ9CQD1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab5aQ9CQD1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab5aQ9CQD1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab5aQ9CQD1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab5aQ9CQD1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab5aQ9CQD1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab5aQ9CQD1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab5aQ9CQD1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab5aQ9CQD1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab5aQ9CQD1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab5aQ9CQD1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab5aQ9CQD1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab5aQ9CQD1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab5aQ9CQD1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab5aQ9CQD1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab5aQ9CQD1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab5aQ9CQD1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rab5aQ9CQD1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rab5aQ9CQD1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab5aQ9CQD1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab5aQ9CQD1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab5aQ9CQD1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab5aQ9CQD1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab5aQ9CQD1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab5aQ9CQD1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab5aQ9CQD1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab5aQ9CQD1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms