Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ22

Lamtor1, Ragulator complex protein LAMTOR1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamtor1Q9CQ22 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamtor1Q9CQ22 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamtor1Q9CQ22 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamtor1Q9CQ22 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamtor1Q9CQ22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamtor1Q9CQ22 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamtor1Q9CQ22 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamtor1Q9CQ22 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamtor1Q9CQ22 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamtor1Q9CQ22 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamtor1Q9CQ22 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamtor1Q9CQ22 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamtor1Q9CQ22 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamtor1Q9CQ22 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamtor1Q9CQ22 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamtor1Q9CQ22 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamtor1Q9CQ22 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamtor1Q9CQ22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamtor1Q9CQ22 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamtor1Q9CQ22 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamtor1Q9CQ22 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lamtor1Q9CQ22 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lamtor1Q9CQ22 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lamtor1Q9CQ22 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lamtor1Q9CQ22 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamtor1Q9CQ22 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lamtor1Q9CQ22 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lamtor1Q9CQ22 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamtor1Q9CQ22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lamtor1Q9CQ22 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lamtor1Q9CQ22 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lamtor1Q9CQ22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lamtor1Q9CQ22 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamtor1Q9CQ22 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamtor1Q9CQ22 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lamtor1Q9CQ22 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lamtor1Q9CQ22 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamtor1Q9CQ22 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamtor1Q9CQ22 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamtor1Q9CQ22 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamtor1Q9CQ22 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamtor1Q9CQ22 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamtor1Q9CQ22 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamtor1Q9CQ22 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamtor1Q9CQ22 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamtor1Q9CQ22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamtor1Q9CQ22 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamtor1Q9CQ22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lamtor1Q9CQ22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lamtor1Q9CQ22 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamtor1Q9CQ22 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamtor1Q9CQ22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lamtor1Q9CQ22 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lamtor1Q9CQ22 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lamtor1Q9CQ22 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lamtor1Q9CQ22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lamtor1Q9CQ22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lamtor1Q9CQ22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lamtor1Q9CQ22 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lamtor1Q9CQ22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lamtor1Q9CQ22 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamtor1Q9CQ22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamtor1Q9CQ22 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lamtor1Q9CQ22 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamtor1Q9CQ22 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamtor1Q9CQ22 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamtor1Q9CQ22 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamtor1Q9CQ22 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamtor1Q9CQ22 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamtor1Q9CQ22 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamtor1Q9CQ22 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamtor1Q9CQ22 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lamtor1Q9CQ22 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms