Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tdrd1Q99MV1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Tdrd1Q99MV1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tdrd1Q99MV1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Tdrd1Q99MV1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Tdrd1Q99MV1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Tdrd1Q99MV1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tdrd1Q99MV1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Tdrd1Q99MV1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tdrd1Q99MV1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Tdrd1Q99MV1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Tdrd1Q99MV1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Tdrd1Q99MV1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Tdrd1Q99MV1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tdrd1Q99MV1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Tdrd1Q99MV1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Tdrd1Q99MV1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tdrd1Q99MV1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tdrd1Q99MV1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tdrd1Q99MV1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Tdrd1Q99MV1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd1Q99MV1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd1Q99MV1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Tdrd1Q99MV1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tdrd1Q99MV1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Tdrd1Q99MV1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Tdrd1Q99MV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Tdrd1Q99MV1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Tdrd1Q99MV1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tdrd1Q99MV1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tdrd1Q99MV1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Tdrd1Q99MV1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Tdrd1Q99MV1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Tdrd1Q99MV1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tdrd1Q99MV1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tdrd1Q99MV1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tdrd1Q99MV1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tdrd1Q99MV1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Tdrd1Q99MV1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Tdrd1Q99MV1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Tdrd1Q99MV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tdrd1Q99MV1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tdrd1Q99MV1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tdrd1Q99MV1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tdrd1Q99MV1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Tdrd1Q99MV1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tdrd1Q99MV1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tdrd1Q99MV1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tdrd1Q99MV1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tdrd1Q99MV1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Tdrd1Q99MV1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd1Q99MV1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd1Q99MV1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tdrd1Q99MV1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tdrd1Q99MV1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tdrd1Q99MV1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tdrd1Q99MV1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tdrd1Q99MV1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tdrd1Q99MV1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Tdrd1Q99MV1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tdrd1Q99MV1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tdrd1Q99MV1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tdrd1Q99MV1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tdrd1Q99MV1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Tdrd1Q99MV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tdrd1Q99MV1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Tdrd1Q99MV1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Tdrd1Q99MV1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tdrd1Q99MV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tdrd1Q99MV1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tdrd1Q99MV1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Tdrd1Q99MV1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tdrd1Q99MV1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tdrd1Q99MV1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tdrd1Q99MV1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tdrd1Q99MV1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tdrd1Q99MV1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tdrd1Q99MV1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tdrd1Q99MV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tdrd1Q99MV1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tdrd1Q99MV1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tdrd1Q99MV1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Tdrd1Q99MV1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tdrd1Q99MV1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tdrd1Q99MV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tdrd1Q99MV1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tdrd1Q99MV1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tdrd1Q99MV1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms