Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS7

Ehbp1l1, EH domain-binding protein 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehbp1l1Q99MS7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Ehbp1l1Q99MS7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Ehbp1l1Q99MS7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Ehbp1l1Q99MS7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ehbp1l1Q99MS7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ehbp1l1Q99MS7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
Ehbp1l1Q99MS7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Ehbp1l1Q99MS7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Ehbp1l1Q99MS7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ehbp1l1Q99MS7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ehbp1l1Q99MS7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Ehbp1l1Q99MS7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
Ehbp1l1Q99MS7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Ehbp1l1Q99MS7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Ehbp1l1Q99MS7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Ehbp1l1Q99MS7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
Ehbp1l1Q99MS7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ehbp1l1Q99MS7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Ehbp1l1Q99MS7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Ehbp1l1Q99MS7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Ehbp1l1Q99MS7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ehbp1l1Q99MS7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ehbp1l1Q99MS7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Ehbp1l1Q99MS7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ehbp1l1Q99MS7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ehbp1l1Q99MS7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Ehbp1l1Q99MS7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ehbp1l1Q99MS7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Ehbp1l1Q99MS7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ehbp1l1Q99MS7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Ehbp1l1Q99MS7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ehbp1l1Q99MS7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ehbp1l1Q99MS7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ehbp1l1Q99MS7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ehbp1l1Q99MS7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ehbp1l1Q99MS7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
Ehbp1l1Q99MS7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Ehbp1l1Q99MS7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Ehbp1l1Q99MS7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Ehbp1l1Q99MS7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ehbp1l1Q99MS7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ehbp1l1Q99MS7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ehbp1l1Q99MS7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ehbp1l1Q99MS7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ehbp1l1Q99MS7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ehbp1l1Q99MS7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ehbp1l1Q99MS7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ehbp1l1Q99MS7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ehbp1l1Q99MS7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ehbp1l1Q99MS7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ehbp1l1Q99MS7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Ehbp1l1Q99MS7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ehbp1l1Q99MS7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ehbp1l1Q99MS7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ehbp1l1Q99MS7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ehbp1l1Q99MS7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Ehbp1l1Q99MS7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Ehbp1l1Q99MS7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ehbp1l1Q99MS7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ehbp1l1Q99MS7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ehbp1l1Q99MS7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ehbp1l1Q99MS7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ehbp1l1Q99MS7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ehbp1l1Q99MS7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ehbp1l1Q99MS7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ehbp1l1Q99MS7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ehbp1l1Q99MS7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ehbp1l1Q99MS7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ehbp1l1Q99MS7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ehbp1l1Q99MS7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ehbp1l1Q99MS7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ehbp1l1Q99MS7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ehbp1l1Q99MS7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ehbp1l1Q99MS7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Ehbp1l1Q99MS7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Ehbp1l1Q99MS7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ehbp1l1Q99MS7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ehbp1l1Q99MS7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ehbp1l1Q99MS7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ehbp1l1Q99MS7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ehbp1l1Q99MS7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ehbp1l1Q99MS7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ehbp1l1Q99MS7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Ehbp1l1Q99MS7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ehbp1l1Q99MS7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ehbp1l1Q99MS7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ehbp1l1Q99MS7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Ehbp1l1Q99MS7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Ehbp1l1Q99MS7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ehbp1l1Q99MS7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ehbp1l1Q99MS7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ehbp1l1Q99MS7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ehbp1l1Q99MS7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ehbp1l1Q99MS7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ehbp1l1Q99MS7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ehbp1l1Q99MS7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ehbp1l1Q99MS7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ehbp1l1Q99MS7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Ehbp1l1Q99MS7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ehbp1l1Q99MS7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms