Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML2

Tnk1, Non-receptor tyrosine-protein kinase TNK1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk1Q99ML2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnk1Q99ML2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnk1Q99ML2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnk1Q99ML2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnk1Q99ML2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnk1Q99ML2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnk1Q99ML2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnk1Q99ML2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnk1Q99ML2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnk1Q99ML2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnk1Q99ML2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnk1Q99ML2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnk1Q99ML2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnk1Q99ML2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnk1Q99ML2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnk1Q99ML2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnk1Q99ML2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnk1Q99ML2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnk1Q99ML2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnk1Q99ML2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnk1Q99ML2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tnk1Q99ML2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnk1Q99ML2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnk1Q99ML2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnk1Q99ML2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnk1Q99ML2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnk1Q99ML2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnk1Q99ML2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnk1Q99ML2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tnk1Q99ML2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tnk1Q99ML2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnk1Q99ML2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnk1Q99ML2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnk1Q99ML2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnk1Q99ML2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnk1Q99ML2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnk1Q99ML2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnk1Q99ML2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnk1Q99ML2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnk1Q99ML2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnk1Q99ML2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnk1Q99ML2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnk1Q99ML2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnk1Q99ML2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnk1Q99ML2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnk1Q99ML2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnk1Q99ML2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnk1Q99ML2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnk1Q99ML2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnk1Q99ML2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnk1Q99ML2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnk1Q99ML2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnk1Q99ML2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnk1Q99ML2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnk1Q99ML2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnk1Q99ML2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnk1Q99ML2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnk1Q99ML2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnk1Q99ML2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnk1Q99ML2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnk1Q99ML2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnk1Q99ML2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnk1Q99ML2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnk1Q99ML2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnk1Q99ML2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnk1Q99ML2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnk1Q99ML2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnk1Q99ML2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnk1Q99ML2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk1Q99ML2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk1Q99ML2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnk1Q99ML2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnk1Q99ML2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnk1Q99ML2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnk1Q99ML2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnk1Q99ML2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnk1Q99ML2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnk1Q99ML2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnk1Q99ML2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnk1Q99ML2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnk1Q99ML2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnk1Q99ML2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tnk1Q99ML2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnk1Q99ML2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnk1Q99ML2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnk1Q99ML2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnk1Q99ML2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnk1Q99ML2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnk1Q99ML2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnk1Q99ML2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnk1Q99ML2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms