Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Spef1Q99JL1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Spef1Q99JL1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spef1Q99JL1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spef1Q99JL1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spef1Q99JL1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Spef1Q99JL1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Spef1Q99JL1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Spef1Q99JL1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spef1Q99JL1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spef1Q99JL1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spef1Q99JL1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spef1Q99JL1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef1Q99JL1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spef1Q99JL1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef1Q99JL1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spef1Q99JL1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spef1Q99JL1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef1Q99JL1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef1Q99JL1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spef1Q99JL1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spef1Q99JL1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef1Q99JL1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef1Q99JL1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spef1Q99JL1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spef1Q99JL1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spef1Q99JL1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef1Q99JL1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef1Q99JL1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spef1Q99JL1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef1Q99JL1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef1Q99JL1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Spef1Q99JL1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spef1Q99JL1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spef1Q99JL1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Spef1Q99JL1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spef1Q99JL1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spef1Q99JL1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spef1Q99JL1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spef1Q99JL1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spef1Q99JL1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spef1Q99JL1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spef1Q99JL1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spef1Q99JL1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spef1Q99JL1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spef1Q99JL1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spef1Q99JL1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spef1Q99JL1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spef1Q99JL1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef1Q99JL1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spef1Q99JL1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spef1Q99JL1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef1Q99JL1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef1Q99JL1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spef1Q99JL1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spef1Q99JL1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef1Q99JL1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef1Q99JL1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spef1Q99JL1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Spef1Q99JL1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spef1Q99JL1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spef1Q99JL1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spef1Q99JL1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spef1Q99JL1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spef1Q99JL1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spef1Q99JL1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spef1Q99JL1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Spef1Q99JL1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spef1Q99JL1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spef1Q99JL1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef1Q99JL1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef1Q99JL1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef1Q99JL1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef1Q99JL1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef1Q99JL1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef1Q99JL1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef1Q99JL1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef1Q99JL1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef1Q99JL1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Spef1Q99JL1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef1Q99JL1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spef1Q99JL1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Spef1Q99JL1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spef1Q99JL1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spef1Q99JL1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spef1Q99JL1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spef1Q99JL1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spef1Q99JL1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spef1Q99JL1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef1Q99JL1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spef1Q99JL1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spef1Q99JL1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms