Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CsprsQ99388 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CsprsQ99388 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CsprsQ99388 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CsprsQ99388 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CsprsQ99388 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CsprsQ99388 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CsprsQ99388 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CsprsQ99388 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CsprsQ99388 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CsprsQ99388 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CsprsQ99388 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CsprsQ99388 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CsprsQ99388 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CsprsQ99388 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CsprsQ99388 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CsprsQ99388 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CsprsQ99388 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CsprsQ99388 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CsprsQ99388 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CsprsQ99388 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CsprsQ99388 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CsprsQ99388 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CsprsQ99388 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CsprsQ99388 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CsprsQ99388 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CsprsQ99388 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CsprsQ99388 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CsprsQ99388 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CsprsQ99388 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CsprsQ99388 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CsprsQ99388 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CsprsQ99388 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CsprsQ99388 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CsprsQ99388 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CsprsQ99388 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CsprsQ99388 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CsprsQ99388 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CsprsQ99388 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CsprsQ99388 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CsprsQ99388 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CsprsQ99388 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CsprsQ99388 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CsprsQ99388 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CsprsQ99388 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CsprsQ99388 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CsprsQ99388 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CsprsQ99388 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CsprsQ99388 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CsprsQ99388 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CsprsQ99388 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CsprsQ99388 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CsprsQ99388 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CsprsQ99388 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CsprsQ99388 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CsprsQ99388 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CsprsQ99388 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CsprsQ99388 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CsprsQ99388 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CsprsQ99388 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CsprsQ99388 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CsprsQ99388 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CsprsQ99388 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CsprsQ99388 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CsprsQ99388 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CsprsQ99388 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CsprsQ99388 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CsprsQ99388 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CsprsQ99388 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms