Protein–RNA interactions for Protein: Q925U4

Edem1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem1Q925U4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Edem1Q925U4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Edem1Q925U4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Edem1Q925U4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Edem1Q925U4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Edem1Q925U4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edem1Q925U4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Edem1Q925U4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Edem1Q925U4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Edem1Q925U4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Edem1Q925U4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Edem1Q925U4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Edem1Q925U4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Edem1Q925U4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Edem1Q925U4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Edem1Q925U4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Edem1Q925U4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Edem1Q925U4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Edem1Q925U4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Edem1Q925U4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Edem1Q925U4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edem1Q925U4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edem1Q925U4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edem1Q925U4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edem1Q925U4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edem1Q925U4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Edem1Q925U4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edem1Q925U4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Edem1Q925U4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Edem1Q925U4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Edem1Q925U4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Edem1Q925U4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Edem1Q925U4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Edem1Q925U4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Edem1Q925U4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Edem1Q925U4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Edem1Q925U4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Edem1Q925U4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edem1Q925U4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edem1Q925U4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Edem1Q925U4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Edem1Q925U4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edem1Q925U4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Edem1Q925U4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Edem1Q925U4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edem1Q925U4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edem1Q925U4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edem1Q925U4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Edem1Q925U4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Edem1Q925U4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Edem1Q925U4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Edem1Q925U4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Edem1Q925U4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Edem1Q925U4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Edem1Q925U4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Edem1Q925U4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edem1Q925U4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edem1Q925U4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Edem1Q925U4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Edem1Q925U4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edem1Q925U4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edem1Q925U4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edem1Q925U4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Edem1Q925U4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edem1Q925U4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Edem1Q925U4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Edem1Q925U4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edem1Q925U4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edem1Q925U4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edem1Q925U4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edem1Q925U4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Edem1Q925U4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Edem1Q925U4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Edem1Q925U4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Edem1Q925U4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Edem1Q925U4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Edem1Q925U4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Edem1Q925U4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Edem1Q925U4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Edem1Q925U4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Edem1Q925U4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Edem1Q925U4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Edem1Q925U4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Edem1Q925U4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Edem1Q925U4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Edem1Q925U4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Edem1Q925U4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Edem1Q925U4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Edem1Q925U4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Edem1Q925U4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Edem1Q925U4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms