Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Klhdc4Q921I2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Klhdc4Q921I2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Klhdc4Q921I2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Klhdc4Q921I2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Klhdc4Q921I2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Klhdc4Q921I2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Klhdc4Q921I2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Klhdc4Q921I2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Klhdc4Q921I2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Klhdc4Q921I2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Klhdc4Q921I2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Klhdc4Q921I2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Klhdc4Q921I2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Klhdc4Q921I2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Klhdc4Q921I2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Klhdc4Q921I2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Klhdc4Q921I2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Klhdc4Q921I2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Klhdc4Q921I2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Klhdc4Q921I2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Klhdc4Q921I2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Klhdc4Q921I2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Klhdc4Q921I2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Klhdc4Q921I2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Klhdc4Q921I2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Klhdc4Q921I2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Klhdc4Q921I2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Klhdc4Q921I2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Klhdc4Q921I2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Klhdc4Q921I2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Klhdc4Q921I2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Klhdc4Q921I2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Klhdc4Q921I2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Klhdc4Q921I2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Klhdc4Q921I2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Klhdc4Q921I2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Klhdc4Q921I2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Klhdc4Q921I2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Klhdc4Q921I2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Klhdc4Q921I2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Klhdc4Q921I2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Klhdc4Q921I2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Klhdc4Q921I2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Klhdc4Q921I2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Klhdc4Q921I2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Klhdc4Q921I2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Klhdc4Q921I2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Klhdc4Q921I2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Klhdc4Q921I2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Klhdc4Q921I2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Klhdc4Q921I2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Klhdc4Q921I2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Klhdc4Q921I2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Klhdc4Q921I2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Klhdc4Q921I2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Klhdc4Q921I2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Klhdc4Q921I2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Klhdc4Q921I2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Klhdc4Q921I2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Klhdc4Q921I2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Klhdc4Q921I2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Klhdc4Q921I2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Klhdc4Q921I2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Klhdc4Q921I2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Klhdc4Q921I2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Klhdc4Q921I2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Klhdc4Q921I2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Klhdc4Q921I2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Klhdc4Q921I2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Klhdc4Q921I2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Klhdc4Q921I2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Klhdc4Q921I2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Klhdc4Q921I2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Klhdc4Q921I2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Klhdc4Q921I2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Klhdc4Q921I2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Klhdc4Q921I2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Klhdc4Q921I2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Klhdc4Q921I2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Klhdc4Q921I2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Klhdc4Q921I2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Klhdc4Q921I2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Klhdc4Q921I2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Klhdc4Q921I2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Klhdc4Q921I2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Klhdc4Q921I2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Klhdc4Q921I2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Klhdc4Q921I2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Klhdc4Q921I2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Klhdc4Q921I2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Klhdc4Q921I2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Klhdc4Q921I2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Klhdc4Q921I2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Klhdc4Q921I2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Klhdc4Q921I2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Klhdc4Q921I2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Klhdc4Q921I2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Klhdc4Q921I2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Klhdc4Q921I2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms