Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nxnl1Q8VC33 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nxnl1Q8VC33 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Nxnl1Q8VC33 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nxnl1Q8VC33 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Nxnl1Q8VC33 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nxnl1Q8VC33 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nxnl1Q8VC33 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nxnl1Q8VC33 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nxnl1Q8VC33 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nxnl1Q8VC33 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nxnl1Q8VC33 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nxnl1Q8VC33 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nxnl1Q8VC33 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nxnl1Q8VC33 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nxnl1Q8VC33 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Nxnl1Q8VC33 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nxnl1Q8VC33 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nxnl1Q8VC33 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nxnl1Q8VC33 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nxnl1Q8VC33 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nxnl1Q8VC33 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nxnl1Q8VC33 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nxnl1Q8VC33 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nxnl1Q8VC33 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nxnl1Q8VC33 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nxnl1Q8VC33 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nxnl1Q8VC33 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nxnl1Q8VC33 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nxnl1Q8VC33 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nxnl1Q8VC33 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nxnl1Q8VC33 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nxnl1Q8VC33 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nxnl1Q8VC33 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nxnl1Q8VC33 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nxnl1Q8VC33 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nxnl1Q8VC33 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nxnl1Q8VC33 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nxnl1Q8VC33 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nxnl1Q8VC33 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nxnl1Q8VC33 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nxnl1Q8VC33 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nxnl1Q8VC33 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nxnl1Q8VC33 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nxnl1Q8VC33 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Nxnl1Q8VC33 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nxnl1Q8VC33 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nxnl1Q8VC33 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nxnl1Q8VC33 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nxnl1Q8VC33 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nxnl1Q8VC33 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nxnl1Q8VC33 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nxnl1Q8VC33 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nxnl1Q8VC33 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nxnl1Q8VC33 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nxnl1Q8VC33 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nxnl1Q8VC33 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nxnl1Q8VC33 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nxnl1Q8VC33 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nxnl1Q8VC33 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nxnl1Q8VC33 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nxnl1Q8VC33 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nxnl1Q8VC33 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nxnl1Q8VC33 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nxnl1Q8VC33 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Nxnl1Q8VC33 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nxnl1Q8VC33 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nxnl1Q8VC33 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nxnl1Q8VC33 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nxnl1Q8VC33 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nxnl1Q8VC33 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nxnl1Q8VC33 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nxnl1Q8VC33 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nxnl1Q8VC33 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nxnl1Q8VC33 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nxnl1Q8VC33 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nxnl1Q8VC33 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nxnl1Q8VC33 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nxnl1Q8VC33 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nxnl1Q8VC33 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nxnl1Q8VC33 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nxnl1Q8VC33 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Nxnl1Q8VC33 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nxnl1Q8VC33 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nxnl1Q8VC33 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nxnl1Q8VC33 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nxnl1Q8VC33 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nxnl1Q8VC33 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nxnl1Q8VC33 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nxnl1Q8VC33 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nxnl1Q8VC33 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nxnl1Q8VC33 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nxnl1Q8VC33 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Nxnl1Q8VC33 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nxnl1Q8VC33 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nxnl1Q8VC33 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nxnl1Q8VC33 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nxnl1Q8VC33 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nxnl1Q8VC33 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nxnl1Q8VC33 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms