Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RttnQ8R4Y8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RttnQ8R4Y8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RttnQ8R4Y8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RttnQ8R4Y8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RttnQ8R4Y8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RttnQ8R4Y8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RttnQ8R4Y8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RttnQ8R4Y8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RttnQ8R4Y8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RttnQ8R4Y8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RttnQ8R4Y8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RttnQ8R4Y8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RttnQ8R4Y8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RttnQ8R4Y8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RttnQ8R4Y8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RttnQ8R4Y8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RttnQ8R4Y8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RttnQ8R4Y8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RttnQ8R4Y8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RttnQ8R4Y8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RttnQ8R4Y8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RttnQ8R4Y8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RttnQ8R4Y8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RttnQ8R4Y8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RttnQ8R4Y8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RttnQ8R4Y8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RttnQ8R4Y8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RttnQ8R4Y8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RttnQ8R4Y8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RttnQ8R4Y8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RttnQ8R4Y8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RttnQ8R4Y8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RttnQ8R4Y8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RttnQ8R4Y8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RttnQ8R4Y8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RttnQ8R4Y8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RttnQ8R4Y8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RttnQ8R4Y8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RttnQ8R4Y8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RttnQ8R4Y8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RttnQ8R4Y8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RttnQ8R4Y8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RttnQ8R4Y8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RttnQ8R4Y8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RttnQ8R4Y8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RttnQ8R4Y8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RttnQ8R4Y8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RttnQ8R4Y8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RttnQ8R4Y8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RttnQ8R4Y8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RttnQ8R4Y8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RttnQ8R4Y8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RttnQ8R4Y8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RttnQ8R4Y8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RttnQ8R4Y8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RttnQ8R4Y8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RttnQ8R4Y8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RttnQ8R4Y8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RttnQ8R4Y8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RttnQ8R4Y8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RttnQ8R4Y8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RttnQ8R4Y8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RttnQ8R4Y8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RttnQ8R4Y8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RttnQ8R4Y8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RttnQ8R4Y8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RttnQ8R4Y8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RttnQ8R4Y8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RttnQ8R4Y8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RttnQ8R4Y8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RttnQ8R4Y8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RttnQ8R4Y8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RttnQ8R4Y8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RttnQ8R4Y8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RttnQ8R4Y8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RttnQ8R4Y8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RttnQ8R4Y8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RttnQ8R4Y8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RttnQ8R4Y8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RttnQ8R4Y8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RttnQ8R4Y8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RttnQ8R4Y8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RttnQ8R4Y8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RttnQ8R4Y8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RttnQ8R4Y8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RttnQ8R4Y8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RttnQ8R4Y8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RttnQ8R4Y8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RttnQ8R4Y8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RttnQ8R4Y8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RttnQ8R4Y8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RttnQ8R4Y8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RttnQ8R4Y8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms