Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm8Q8R4D5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm8Q8R4D5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpm8Q8R4D5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trpm8Q8R4D5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm8Q8R4D5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm8Q8R4D5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm8Q8R4D5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm8Q8R4D5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm8Q8R4D5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm8Q8R4D5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm8Q8R4D5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpm8Q8R4D5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpm8Q8R4D5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpm8Q8R4D5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm8Q8R4D5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpm8Q8R4D5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm8Q8R4D5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpm8Q8R4D5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm8Q8R4D5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm8Q8R4D5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm8Q8R4D5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm8Q8R4D5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm8Q8R4D5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm8Q8R4D5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm8Q8R4D5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm8Q8R4D5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm8Q8R4D5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm8Q8R4D5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm8Q8R4D5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpm8Q8R4D5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trpm8Q8R4D5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm8Q8R4D5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpm8Q8R4D5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm8Q8R4D5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpm8Q8R4D5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm8Q8R4D5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpm8Q8R4D5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpm8Q8R4D5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpm8Q8R4D5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm8Q8R4D5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm8Q8R4D5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpm8Q8R4D5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpm8Q8R4D5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm8Q8R4D5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpm8Q8R4D5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm8Q8R4D5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpm8Q8R4D5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm8Q8R4D5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpm8Q8R4D5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm8Q8R4D5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpm8Q8R4D5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpm8Q8R4D5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trpm8Q8R4D5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpm8Q8R4D5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm8Q8R4D5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpm8Q8R4D5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpm8Q8R4D5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpm8Q8R4D5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpm8Q8R4D5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpm8Q8R4D5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpm8Q8R4D5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpm8Q8R4D5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpm8Q8R4D5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpm8Q8R4D5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpm8Q8R4D5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpm8Q8R4D5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpm8Q8R4D5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpm8Q8R4D5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm8Q8R4D5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm8Q8R4D5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpm8Q8R4D5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpm8Q8R4D5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm8Q8R4D5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpm8Q8R4D5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpm8Q8R4D5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpm8Q8R4D5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm8Q8R4D5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm8Q8R4D5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpm8Q8R4D5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trpm8Q8R4D5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trpm8Q8R4D5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trpm8Q8R4D5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpm8Q8R4D5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trpm8Q8R4D5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trpm8Q8R4D5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trpm8Q8R4D5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm8Q8R4D5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trpm8Q8R4D5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpm8Q8R4D5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trpm8Q8R4D5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trpm8Q8R4D5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trpm8Q8R4D5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm8Q8R4D5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trpm8Q8R4D5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm8Q8R4D5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trpm8Q8R4D5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trpm8Q8R4D5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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