Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r212Q8R268 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vmn1r212Q8R268 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r212Q8R268 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r212Q8R268 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r212Q8R268 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r212Q8R268 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r212Q8R268 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r212Q8R268 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r212Q8R268 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r212Q8R268 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r212Q8R268 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r212Q8R268 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r212Q8R268 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r212Q8R268 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r212Q8R268 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vmn1r212Q8R268 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r212Q8R268 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r212Q8R268 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r212Q8R268 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r212Q8R268 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r212Q8R268 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vmn1r212Q8R268 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r212Q8R268 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r212Q8R268 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r212Q8R268 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r212Q8R268 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r212Q8R268 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vmn1r212Q8R268 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vmn1r212Q8R268 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vmn1r212Q8R268 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vmn1r212Q8R268 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vmn1r212Q8R268 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn1r212Q8R268 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r212Q8R268 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r212Q8R268 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vmn1r212Q8R268 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r212Q8R268 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r212Q8R268 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vmn1r212Q8R268 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn1r212Q8R268 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r212Q8R268 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r212Q8R268 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vmn1r212Q8R268 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn1r212Q8R268 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn1r212Q8R268 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vmn1r212Q8R268 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn1r212Q8R268 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn1r212Q8R268 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vmn1r212Q8R268 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vmn1r212Q8R268 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r212Q8R268 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn1r212Q8R268 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn1r212Q8R268 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vmn1r212Q8R268 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vmn1r212Q8R268 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r212Q8R268 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r212Q8R268 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn1r212Q8R268 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r212Q8R268 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r212Q8R268 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r212Q8R268 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r212Q8R268 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r212Q8R268 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r212Q8R268 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r212Q8R268 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r212Q8R268 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r212Q8R268 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r212Q8R268 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r212Q8R268 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r212Q8R268 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r212Q8R268 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r212Q8R268 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r212Q8R268 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r212Q8R268 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r212Q8R268 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r212Q8R268 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r212Q8R268 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r212Q8R268 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r212Q8R268 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r212Q8R268 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r212Q8R268 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r212Q8R268 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r212Q8R268 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn1r212Q8R268 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r212Q8R268 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r212Q8R268 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r212Q8R268 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r212Q8R268 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r212Q8R268 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r212Q8R268 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms