Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Y2

Uncharacterized protein C16orf45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R1Y2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8R1Y2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8R1Y2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Q8R1Y2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q8R1Y2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q8R1Y2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8R1Y2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8R1Y2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q8R1Y2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q8R1Y2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q8R1Y2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q8R1Y2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q8R1Y2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q8R1Y2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q8R1Y2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8R1Y2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8R1Y2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8R1Y2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Q8R1Y2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q8R1Y2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q8R1Y2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q8R1Y2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Q8R1Y2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Q8R1Y2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Q8R1Y2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q8R1Y2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Q8R1Y2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Q8R1Y2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8R1Y2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Q8R1Y2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Q8R1Y2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q8R1Y2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q8R1Y2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8R1Y2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q8R1Y2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q8R1Y2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8R1Y2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q8R1Y2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q8R1Y2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q8R1Y2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q8R1Y2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8R1Y2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8R1Y2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q8R1Y2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Q8R1Y2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8R1Y2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q8R1Y2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q8R1Y2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q8R1Y2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8R1Y2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q8R1Y2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q8R1Y2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q8R1Y2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q8R1Y2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q8R1Y2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8R1Y2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q8R1Y2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8R1Y2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8R1Y2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q8R1Y2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q8R1Y2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8R1Y2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q8R1Y2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8R1Y2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q8R1Y2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q8R1Y2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q8R1Y2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q8R1Y2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q8R1Y2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q8R1Y2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q8R1Y2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q8R1Y2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q8R1Y2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q8R1Y2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q8R1Y2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q8R1Y2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8R1Y2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q8R1Y2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q8R1Y2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Q8R1Y2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8R1Y2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q8R1Y2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms