Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxc12Q8K5B8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc12Q8K5B8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc12Q8K5B8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc12Q8K5B8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxc12Q8K5B8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxc12Q8K5B8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxc12Q8K5B8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxc12Q8K5B8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxc12Q8K5B8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc12Q8K5B8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc12Q8K5B8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc12Q8K5B8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc12Q8K5B8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc12Q8K5B8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc12Q8K5B8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc12Q8K5B8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc12Q8K5B8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc12Q8K5B8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc12Q8K5B8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc12Q8K5B8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc12Q8K5B8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc12Q8K5B8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc12Q8K5B8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc12Q8K5B8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc12Q8K5B8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc12Q8K5B8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc12Q8K5B8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc12Q8K5B8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc12Q8K5B8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc12Q8K5B8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc12Q8K5B8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc12Q8K5B8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc12Q8K5B8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc12Q8K5B8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc12Q8K5B8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc12Q8K5B8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc12Q8K5B8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc12Q8K5B8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc12Q8K5B8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxc12Q8K5B8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc12Q8K5B8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc12Q8K5B8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc12Q8K5B8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc12Q8K5B8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc12Q8K5B8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc12Q8K5B8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc12Q8K5B8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc12Q8K5B8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc12Q8K5B8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc12Q8K5B8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc12Q8K5B8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc12Q8K5B8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc12Q8K5B8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc12Q8K5B8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc12Q8K5B8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc12Q8K5B8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc12Q8K5B8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc12Q8K5B8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc12Q8K5B8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc12Q8K5B8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc12Q8K5B8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc12Q8K5B8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc12Q8K5B8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc12Q8K5B8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc12Q8K5B8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc12Q8K5B8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc12Q8K5B8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc12Q8K5B8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc12Q8K5B8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc12Q8K5B8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc12Q8K5B8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc12Q8K5B8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc12Q8K5B8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc12Q8K5B8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc12Q8K5B8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc12Q8K5B8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc12Q8K5B8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc12Q8K5B8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc12Q8K5B8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc12Q8K5B8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc12Q8K5B8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc12Q8K5B8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc12Q8K5B8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc12Q8K5B8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc12Q8K5B8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc12Q8K5B8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms