Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Colec12Q8K4Q8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Colec12Q8K4Q8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Colec12Q8K4Q8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Colec12Q8K4Q8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Colec12Q8K4Q8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Colec12Q8K4Q8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Colec12Q8K4Q8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Colec12Q8K4Q8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Colec12Q8K4Q8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Colec12Q8K4Q8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Colec12Q8K4Q8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Colec12Q8K4Q8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Colec12Q8K4Q8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Colec12Q8K4Q8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Colec12Q8K4Q8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Colec12Q8K4Q8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Colec12Q8K4Q8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Colec12Q8K4Q8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Colec12Q8K4Q8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Colec12Q8K4Q8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Colec12Q8K4Q8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Colec12Q8K4Q8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Colec12Q8K4Q8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Colec12Q8K4Q8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Colec12Q8K4Q8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Colec12Q8K4Q8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Colec12Q8K4Q8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Colec12Q8K4Q8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Colec12Q8K4Q8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Colec12Q8K4Q8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Colec12Q8K4Q8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Colec12Q8K4Q8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Colec12Q8K4Q8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Colec12Q8K4Q8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Colec12Q8K4Q8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Colec12Q8K4Q8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Colec12Q8K4Q8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Colec12Q8K4Q8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Colec12Q8K4Q8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Colec12Q8K4Q8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Colec12Q8K4Q8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Colec12Q8K4Q8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Colec12Q8K4Q8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Colec12Q8K4Q8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Colec12Q8K4Q8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Colec12Q8K4Q8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Colec12Q8K4Q8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Colec12Q8K4Q8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Colec12Q8K4Q8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Colec12Q8K4Q8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Colec12Q8K4Q8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Colec12Q8K4Q8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Colec12Q8K4Q8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Colec12Q8K4Q8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Colec12Q8K4Q8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Colec12Q8K4Q8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Colec12Q8K4Q8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Colec12Q8K4Q8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Colec12Q8K4Q8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Colec12Q8K4Q8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Colec12Q8K4Q8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Colec12Q8K4Q8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Colec12Q8K4Q8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Colec12Q8K4Q8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Colec12Q8K4Q8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Colec12Q8K4Q8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Colec12Q8K4Q8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Colec12Q8K4Q8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Colec12Q8K4Q8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Colec12Q8K4Q8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Colec12Q8K4Q8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Colec12Q8K4Q8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Colec12Q8K4Q8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Colec12Q8K4Q8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Colec12Q8K4Q8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Colec12Q8K4Q8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Colec12Q8K4Q8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Colec12Q8K4Q8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Colec12Q8K4Q8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Colec12Q8K4Q8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Colec12Q8K4Q8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colec12Q8K4Q8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Colec12Q8K4Q8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Colec12Q8K4Q8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Colec12Q8K4Q8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colec12Q8K4Q8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Colec12Q8K4Q8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Colec12Q8K4Q8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Colec12Q8K4Q8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Colec12Q8K4Q8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Colec12Q8K4Q8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Colec12Q8K4Q8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Colec12Q8K4Q8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colec12Q8K4Q8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colec12Q8K4Q8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Colec12Q8K4Q8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colec12Q8K4Q8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms