Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L3

Svil, Supervillin, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvilQ8K4L3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SvilQ8K4L3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SvilQ8K4L3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SvilQ8K4L3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SvilQ8K4L3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SvilQ8K4L3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SvilQ8K4L3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SvilQ8K4L3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SvilQ8K4L3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SvilQ8K4L3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SvilQ8K4L3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SvilQ8K4L3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SvilQ8K4L3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SvilQ8K4L3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SvilQ8K4L3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SvilQ8K4L3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SvilQ8K4L3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SvilQ8K4L3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SvilQ8K4L3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SvilQ8K4L3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SvilQ8K4L3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SvilQ8K4L3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SvilQ8K4L3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SvilQ8K4L3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SvilQ8K4L3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SvilQ8K4L3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SvilQ8K4L3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SvilQ8K4L3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SvilQ8K4L3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SvilQ8K4L3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SvilQ8K4L3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SvilQ8K4L3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SvilQ8K4L3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SvilQ8K4L3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SvilQ8K4L3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SvilQ8K4L3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SvilQ8K4L3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SvilQ8K4L3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SvilQ8K4L3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SvilQ8K4L3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SvilQ8K4L3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SvilQ8K4L3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SvilQ8K4L3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SvilQ8K4L3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SvilQ8K4L3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SvilQ8K4L3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SvilQ8K4L3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SvilQ8K4L3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SvilQ8K4L3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SvilQ8K4L3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SvilQ8K4L3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SvilQ8K4L3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SvilQ8K4L3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SvilQ8K4L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SvilQ8K4L3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SvilQ8K4L3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SvilQ8K4L3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SvilQ8K4L3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SvilQ8K4L3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SvilQ8K4L3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SvilQ8K4L3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SvilQ8K4L3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SvilQ8K4L3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SvilQ8K4L3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SvilQ8K4L3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SvilQ8K4L3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SvilQ8K4L3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SvilQ8K4L3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SvilQ8K4L3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SvilQ8K4L3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SvilQ8K4L3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SvilQ8K4L3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SvilQ8K4L3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SvilQ8K4L3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SvilQ8K4L3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SvilQ8K4L3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SvilQ8K4L3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SvilQ8K4L3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SvilQ8K4L3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SvilQ8K4L3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SvilQ8K4L3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SvilQ8K4L3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SvilQ8K4L3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SvilQ8K4L3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms