Protein–RNA interactions for Protein: Q8K071

Tmem221, Transmembrane protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem221Q8K071 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem221Q8K071 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem221Q8K071 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem221Q8K071 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem221Q8K071 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem221Q8K071 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem221Q8K071 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem221Q8K071 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem221Q8K071 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem221Q8K071 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem221Q8K071 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem221Q8K071 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem221Q8K071 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem221Q8K071 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem221Q8K071 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem221Q8K071 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem221Q8K071 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem221Q8K071 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem221Q8K071 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem221Q8K071 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmem221Q8K071 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem221Q8K071 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem221Q8K071 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem221Q8K071 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem221Q8K071 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem221Q8K071 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem221Q8K071 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem221Q8K071 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem221Q8K071 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem221Q8K071 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem221Q8K071 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem221Q8K071 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem221Q8K071 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem221Q8K071 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem221Q8K071 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem221Q8K071 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem221Q8K071 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem221Q8K071 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem221Q8K071 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem221Q8K071 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem221Q8K071 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem221Q8K071 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem221Q8K071 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem221Q8K071 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem221Q8K071 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem221Q8K071 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem221Q8K071 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem221Q8K071 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem221Q8K071 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem221Q8K071 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem221Q8K071 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem221Q8K071 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem221Q8K071 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem221Q8K071 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem221Q8K071 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem221Q8K071 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem221Q8K071 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem221Q8K071 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem221Q8K071 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem221Q8K071 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem221Q8K071 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem221Q8K071 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem221Q8K071 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem221Q8K071 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem221Q8K071 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem221Q8K071 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem221Q8K071 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem221Q8K071 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem221Q8K071 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem221Q8K071 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem221Q8K071 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem221Q8K071 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem221Q8K071 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem221Q8K071 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem221Q8K071 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem221Q8K071 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem221Q8K071 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem221Q8K071 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem221Q8K071 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem221Q8K071 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms