Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pkn3Q8K045 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pkn3Q8K045 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pkn3Q8K045 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pkn3Q8K045 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pkn3Q8K045 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pkn3Q8K045 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkn3Q8K045 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkn3Q8K045 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pkn3Q8K045 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pkn3Q8K045 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkn3Q8K045 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pkn3Q8K045 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pkn3Q8K045 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pkn3Q8K045 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkn3Q8K045 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pkn3Q8K045 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkn3Q8K045 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkn3Q8K045 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkn3Q8K045 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pkn3Q8K045 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkn3Q8K045 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pkn3Q8K045 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pkn3Q8K045 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkn3Q8K045 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pkn3Q8K045 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pkn3Q8K045 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkn3Q8K045 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkn3Q8K045 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkn3Q8K045 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkn3Q8K045 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkn3Q8K045 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pkn3Q8K045 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pkn3Q8K045 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkn3Q8K045 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pkn3Q8K045 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pkn3Q8K045 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pkn3Q8K045 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkn3Q8K045 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pkn3Q8K045 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pkn3Q8K045 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pkn3Q8K045 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pkn3Q8K045 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pkn3Q8K045 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Pkn3Q8K045 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pkn3Q8K045 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pkn3Q8K045 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pkn3Q8K045 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkn3Q8K045 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkn3Q8K045 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pkn3Q8K045 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pkn3Q8K045 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pkn3Q8K045 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pkn3Q8K045 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pkn3Q8K045 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pkn3Q8K045 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkn3Q8K045 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pkn3Q8K045 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkn3Q8K045 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pkn3Q8K045 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pkn3Q8K045 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pkn3Q8K045 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Pkn3Q8K045 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pkn3Q8K045 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pkn3Q8K045 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pkn3Q8K045 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pkn3Q8K045 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkn3Q8K045 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pkn3Q8K045 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pkn3Q8K045 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkn3Q8K045 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pkn3Q8K045 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pkn3Q8K045 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkn3Q8K045 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkn3Q8K045 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkn3Q8K045 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkn3Q8K045 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkn3Q8K045 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkn3Q8K045 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkn3Q8K045 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkn3Q8K045 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pkn3Q8K045 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkn3Q8K045 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkn3Q8K045 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkn3Q8K045 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pkn3Q8K045 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkn3Q8K045 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkn3Q8K045 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pkn3Q8K045 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkn3Q8K045 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkn3Q8K045 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkn3Q8K045 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pkn3Q8K045 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkn3Q8K045 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pkn3Q8K045 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkn3Q8K045 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pkn3Q8K045 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pkn3Q8K045 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkn3Q8K045 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pkn3Q8K045 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms