Protein–RNA interactions for Protein: Q8K025

Frat2, GSK-3-binding protein FRAT2, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat2Q8K025 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Frat2Q8K025 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Frat2Q8K025 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Frat2Q8K025 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Frat2Q8K025 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frat2Q8K025 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Frat2Q8K025 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Frat2Q8K025 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frat2Q8K025 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frat2Q8K025 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Frat2Q8K025 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Frat2Q8K025 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Frat2Q8K025 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frat2Q8K025 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Frat2Q8K025 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Frat2Q8K025 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Frat2Q8K025 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Frat2Q8K025 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Frat2Q8K025 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Frat2Q8K025 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Frat2Q8K025 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Frat2Q8K025 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Frat2Q8K025 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Frat2Q8K025 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frat2Q8K025 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Frat2Q8K025 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frat2Q8K025 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Frat2Q8K025 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Frat2Q8K025 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Frat2Q8K025 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Frat2Q8K025 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Frat2Q8K025 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Frat2Q8K025 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Frat2Q8K025 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Frat2Q8K025 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Frat2Q8K025 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Frat2Q8K025 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Frat2Q8K025 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Frat2Q8K025 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Frat2Q8K025 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Frat2Q8K025 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Frat2Q8K025 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Frat2Q8K025 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Frat2Q8K025 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Frat2Q8K025 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Frat2Q8K025 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Frat2Q8K025 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Frat2Q8K025 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Frat2Q8K025 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Frat2Q8K025 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Frat2Q8K025 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Frat2Q8K025 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Frat2Q8K025 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frat2Q8K025 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Frat2Q8K025 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Frat2Q8K025 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Frat2Q8K025 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Frat2Q8K025 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Frat2Q8K025 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Frat2Q8K025 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Frat2Q8K025 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Frat2Q8K025 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Frat2Q8K025 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frat2Q8K025 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Frat2Q8K025 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frat2Q8K025 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Frat2Q8K025 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Frat2Q8K025 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frat2Q8K025 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Frat2Q8K025 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frat2Q8K025 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frat2Q8K025 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Frat2Q8K025 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Frat2Q8K025 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frat2Q8K025 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Frat2Q8K025 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frat2Q8K025 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frat2Q8K025 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frat2Q8K025 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Frat2Q8K025 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frat2Q8K025 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Frat2Q8K025 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frat2Q8K025 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frat2Q8K025 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frat2Q8K025 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Frat2Q8K025 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frat2Q8K025 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Frat2Q8K025 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frat2Q8K025 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Frat2Q8K025 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frat2Q8K025 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Frat2Q8K025 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Frat2Q8K025 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Frat2Q8K025 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frat2Q8K025 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frat2Q8K025 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frat2Q8K025 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frat2Q8K025 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Frat2Q8K025 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frat2Q8K025 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms