Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CopaQ8CIE6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CopaQ8CIE6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CopaQ8CIE6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CopaQ8CIE6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CopaQ8CIE6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CopaQ8CIE6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CopaQ8CIE6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CopaQ8CIE6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CopaQ8CIE6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CopaQ8CIE6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CopaQ8CIE6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CopaQ8CIE6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CopaQ8CIE6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CopaQ8CIE6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CopaQ8CIE6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CopaQ8CIE6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CopaQ8CIE6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CopaQ8CIE6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CopaQ8CIE6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CopaQ8CIE6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CopaQ8CIE6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CopaQ8CIE6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CopaQ8CIE6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CopaQ8CIE6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CopaQ8CIE6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CopaQ8CIE6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CopaQ8CIE6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CopaQ8CIE6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CopaQ8CIE6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CopaQ8CIE6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CopaQ8CIE6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CopaQ8CIE6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CopaQ8CIE6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CopaQ8CIE6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CopaQ8CIE6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CopaQ8CIE6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CopaQ8CIE6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CopaQ8CIE6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CopaQ8CIE6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CopaQ8CIE6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CopaQ8CIE6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CopaQ8CIE6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CopaQ8CIE6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CopaQ8CIE6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CopaQ8CIE6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CopaQ8CIE6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CopaQ8CIE6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CopaQ8CIE6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CopaQ8CIE6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CopaQ8CIE6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CopaQ8CIE6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CopaQ8CIE6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CopaQ8CIE6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CopaQ8CIE6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CopaQ8CIE6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CopaQ8CIE6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CopaQ8CIE6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CopaQ8CIE6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CopaQ8CIE6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CopaQ8CIE6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CopaQ8CIE6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CopaQ8CIE6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CopaQ8CIE6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CopaQ8CIE6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CopaQ8CIE6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CopaQ8CIE6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CopaQ8CIE6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CopaQ8CIE6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CopaQ8CIE6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CopaQ8CIE6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CopaQ8CIE6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CopaQ8CIE6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CopaQ8CIE6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CopaQ8CIE6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CopaQ8CIE6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CopaQ8CIE6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CopaQ8CIE6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CopaQ8CIE6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CopaQ8CIE6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CopaQ8CIE6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CopaQ8CIE6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CopaQ8CIE6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CopaQ8CIE6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CopaQ8CIE6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CopaQ8CIE6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CopaQ8CIE6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CopaQ8CIE6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CopaQ8CIE6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CopaQ8CIE6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CopaQ8CIE6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CopaQ8CIE6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CopaQ8CIE6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CopaQ8CIE6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CopaQ8CIE6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CopaQ8CIE6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CopaQ8CIE6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CopaQ8CIE6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CopaQ8CIE6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CopaQ8CIE6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms