Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrif1Q8CDD9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrif1Q8CDD9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrif1Q8CDD9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrif1Q8CDD9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrif1Q8CDD9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrif1Q8CDD9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrif1Q8CDD9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrif1Q8CDD9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrif1Q8CDD9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lrif1Q8CDD9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrif1Q8CDD9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lrif1Q8CDD9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrif1Q8CDD9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrif1Q8CDD9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrif1Q8CDD9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrif1Q8CDD9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrif1Q8CDD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrif1Q8CDD9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrif1Q8CDD9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrif1Q8CDD9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrif1Q8CDD9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrif1Q8CDD9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrif1Q8CDD9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrif1Q8CDD9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrif1Q8CDD9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrif1Q8CDD9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrif1Q8CDD9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrif1Q8CDD9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrif1Q8CDD9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrif1Q8CDD9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrif1Q8CDD9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrif1Q8CDD9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrif1Q8CDD9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrif1Q8CDD9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrif1Q8CDD9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrif1Q8CDD9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrif1Q8CDD9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrif1Q8CDD9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrif1Q8CDD9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrif1Q8CDD9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Lrif1Q8CDD9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrif1Q8CDD9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrif1Q8CDD9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrif1Q8CDD9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrif1Q8CDD9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrif1Q8CDD9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrif1Q8CDD9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrif1Q8CDD9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrif1Q8CDD9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrif1Q8CDD9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrif1Q8CDD9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrif1Q8CDD9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrif1Q8CDD9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrif1Q8CDD9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrif1Q8CDD9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrif1Q8CDD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrif1Q8CDD9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrif1Q8CDD9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrif1Q8CDD9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrif1Q8CDD9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrif1Q8CDD9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrif1Q8CDD9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrif1Q8CDD9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrif1Q8CDD9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrif1Q8CDD9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrif1Q8CDD9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrif1Q8CDD9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrif1Q8CDD9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrif1Q8CDD9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrif1Q8CDD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrif1Q8CDD9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrif1Q8CDD9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrif1Q8CDD9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrif1Q8CDD9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrif1Q8CDD9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrif1Q8CDD9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrif1Q8CDD9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrif1Q8CDD9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrif1Q8CDD9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrif1Q8CDD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrif1Q8CDD9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrif1Q8CDD9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrif1Q8CDD9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrif1Q8CDD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrif1Q8CDD9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrif1Q8CDD9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrif1Q8CDD9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrif1Q8CDD9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrif1Q8CDD9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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