Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cacnb2Q8CC27 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cacnb2Q8CC27 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacnb2Q8CC27 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacnb2Q8CC27 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacnb2Q8CC27 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cacnb2Q8CC27 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cacnb2Q8CC27 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cacnb2Q8CC27 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacnb2Q8CC27 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cacnb2Q8CC27 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cacnb2Q8CC27 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cacnb2Q8CC27 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cacnb2Q8CC27 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cacnb2Q8CC27 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacnb2Q8CC27 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacnb2Q8CC27 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cacnb2Q8CC27 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cacnb2Q8CC27 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cacnb2Q8CC27 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacnb2Q8CC27 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacnb2Q8CC27 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacnb2Q8CC27 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacnb2Q8CC27 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacnb2Q8CC27 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacnb2Q8CC27 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cacnb2Q8CC27 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacnb2Q8CC27 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacnb2Q8CC27 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacnb2Q8CC27 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacnb2Q8CC27 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cacnb2Q8CC27 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cacnb2Q8CC27 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacnb2Q8CC27 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cacnb2Q8CC27 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cacnb2Q8CC27 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cacnb2Q8CC27 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacnb2Q8CC27 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cacnb2Q8CC27 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacnb2Q8CC27 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacnb2Q8CC27 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacnb2Q8CC27 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacnb2Q8CC27 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacnb2Q8CC27 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacnb2Q8CC27 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cacnb2Q8CC27 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacnb2Q8CC27 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cacnb2Q8CC27 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacnb2Q8CC27 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cacnb2Q8CC27 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacnb2Q8CC27 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacnb2Q8CC27 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacnb2Q8CC27 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacnb2Q8CC27 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacnb2Q8CC27 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cacnb2Q8CC27 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacnb2Q8CC27 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacnb2Q8CC27 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cacnb2Q8CC27 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cacnb2Q8CC27 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cacnb2Q8CC27 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacnb2Q8CC27 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cacnb2Q8CC27 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cacnb2Q8CC27 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cacnb2Q8CC27 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cacnb2Q8CC27 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb2Q8CC27 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb2Q8CC27 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cacnb2Q8CC27 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacnb2Q8CC27 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cacnb2Q8CC27 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacnb2Q8CC27 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cacnb2Q8CC27 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacnb2Q8CC27 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cacnb2Q8CC27 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacnb2Q8CC27 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacnb2Q8CC27 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacnb2Q8CC27 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cacnb2Q8CC27 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacnb2Q8CC27 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cacnb2Q8CC27 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cacnb2Q8CC27 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cacnb2Q8CC27 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cacnb2Q8CC27 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacnb2Q8CC27 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cacnb2Q8CC27 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cacnb2Q8CC27 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cacnb2Q8CC27 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacnb2Q8CC27 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacnb2Q8CC27 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms