Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Gpc5Q8CAL5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Gpc5Q8CAL5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gpc5Q8CAL5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gpc5Q8CAL5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Gpc5Q8CAL5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gpc5Q8CAL5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gpc5Q8CAL5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Gpc5Q8CAL5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Gpc5Q8CAL5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gpc5Q8CAL5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Gpc5Q8CAL5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gpc5Q8CAL5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gpc5Q8CAL5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Gpc5Q8CAL5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gpc5Q8CAL5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gpc5Q8CAL5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gpc5Q8CAL5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gpc5Q8CAL5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gpc5Q8CAL5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gpc5Q8CAL5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gpc5Q8CAL5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gpc5Q8CAL5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gpc5Q8CAL5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gpc5Q8CAL5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gpc5Q8CAL5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gpc5Q8CAL5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gpc5Q8CAL5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gpc5Q8CAL5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gpc5Q8CAL5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gpc5Q8CAL5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gpc5Q8CAL5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gpc5Q8CAL5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gpc5Q8CAL5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gpc5Q8CAL5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gpc5Q8CAL5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gpc5Q8CAL5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gpc5Q8CAL5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gpc5Q8CAL5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gpc5Q8CAL5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gpc5Q8CAL5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gpc5Q8CAL5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Gpc5Q8CAL5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gpc5Q8CAL5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpc5Q8CAL5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpc5Q8CAL5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gpc5Q8CAL5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gpc5Q8CAL5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gpc5Q8CAL5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gpc5Q8CAL5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gpc5Q8CAL5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpc5Q8CAL5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gpc5Q8CAL5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gpc5Q8CAL5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gpc5Q8CAL5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gpc5Q8CAL5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gpc5Q8CAL5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gpc5Q8CAL5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gpc5Q8CAL5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpc5Q8CAL5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gpc5Q8CAL5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gpc5Q8CAL5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gpc5Q8CAL5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gpc5Q8CAL5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gpc5Q8CAL5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpc5Q8CAL5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Gpc5Q8CAL5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gpc5Q8CAL5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpc5Q8CAL5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gpc5Q8CAL5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpc5Q8CAL5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpc5Q8CAL5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gpc5Q8CAL5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpc5Q8CAL5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gpc5Q8CAL5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gpc5Q8CAL5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gpc5Q8CAL5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gpc5Q8CAL5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gpc5Q8CAL5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gpc5Q8CAL5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gpc5Q8CAL5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gpc5Q8CAL5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Gpc5Q8CAL5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gpc5Q8CAL5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gpc5Q8CAL5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gpc5Q8CAL5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gpc5Q8CAL5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpc5Q8CAL5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpc5Q8CAL5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpc5Q8CAL5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpc5Q8CAL5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpc5Q8CAL5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gpc5Q8CAL5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gpc5Q8CAL5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gpc5Q8CAL5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gpc5Q8CAL5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gpc5Q8CAL5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gpc5Q8CAL5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Gpc5Q8CAL5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gpc5Q8CAL5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms