Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bhlhe22Q8C6A8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bhlhe22Q8C6A8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bhlhe22Q8C6A8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bhlhe22Q8C6A8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bhlhe22Q8C6A8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bhlhe22Q8C6A8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bhlhe22Q8C6A8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bhlhe22Q8C6A8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bhlhe22Q8C6A8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bhlhe22Q8C6A8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bhlhe22Q8C6A8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Bhlhe22Q8C6A8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bhlhe22Q8C6A8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bhlhe22Q8C6A8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bhlhe22Q8C6A8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Bhlhe22Q8C6A8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bhlhe22Q8C6A8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bhlhe22Q8C6A8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bhlhe22Q8C6A8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bhlhe22Q8C6A8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bhlhe22Q8C6A8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bhlhe22Q8C6A8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bhlhe22Q8C6A8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bhlhe22Q8C6A8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bhlhe22Q8C6A8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bhlhe22Q8C6A8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bhlhe22Q8C6A8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Bhlhe22Q8C6A8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bhlhe22Q8C6A8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bhlhe22Q8C6A8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bhlhe22Q8C6A8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Bhlhe22Q8C6A8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bhlhe22Q8C6A8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bhlhe22Q8C6A8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bhlhe22Q8C6A8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bhlhe22Q8C6A8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bhlhe22Q8C6A8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Bhlhe22Q8C6A8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bhlhe22Q8C6A8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bhlhe22Q8C6A8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bhlhe22Q8C6A8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bhlhe22Q8C6A8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bhlhe22Q8C6A8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bhlhe22Q8C6A8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bhlhe22Q8C6A8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bhlhe22Q8C6A8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bhlhe22Q8C6A8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bhlhe22Q8C6A8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bhlhe22Q8C6A8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bhlhe22Q8C6A8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bhlhe22Q8C6A8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bhlhe22Q8C6A8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Bhlhe22Q8C6A8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bhlhe22Q8C6A8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bhlhe22Q8C6A8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bhlhe22Q8C6A8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Bhlhe22Q8C6A8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bhlhe22Q8C6A8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Bhlhe22Q8C6A8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bhlhe22Q8C6A8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bhlhe22Q8C6A8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bhlhe22Q8C6A8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bhlhe22Q8C6A8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bhlhe22Q8C6A8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bhlhe22Q8C6A8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms