Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppfia2Q8BSS9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppfia2Q8BSS9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppfia2Q8BSS9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppfia2Q8BSS9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppfia2Q8BSS9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppfia2Q8BSS9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppfia2Q8BSS9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfia2Q8BSS9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppfia2Q8BSS9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppfia2Q8BSS9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia2Q8BSS9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia2Q8BSS9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppfia2Q8BSS9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppfia2Q8BSS9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppfia2Q8BSS9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppfia2Q8BSS9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppfia2Q8BSS9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppfia2Q8BSS9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ppfia2Q8BSS9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppfia2Q8BSS9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppfia2Q8BSS9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppfia2Q8BSS9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppfia2Q8BSS9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfia2Q8BSS9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppfia2Q8BSS9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppfia2Q8BSS9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppfia2Q8BSS9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppfia2Q8BSS9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppfia2Q8BSS9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppfia2Q8BSS9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppfia2Q8BSS9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppfia2Q8BSS9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppfia2Q8BSS9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfia2Q8BSS9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppfia2Q8BSS9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfia2Q8BSS9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppfia2Q8BSS9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppfia2Q8BSS9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppfia2Q8BSS9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppfia2Q8BSS9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppfia2Q8BSS9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppfia2Q8BSS9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppfia2Q8BSS9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfia2Q8BSS9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfia2Q8BSS9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfia2Q8BSS9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfia2Q8BSS9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfia2Q8BSS9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfia2Q8BSS9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfia2Q8BSS9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfia2Q8BSS9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfia2Q8BSS9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfia2Q8BSS9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ppfia2Q8BSS9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ppfia2Q8BSS9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfia2Q8BSS9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfia2Q8BSS9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfia2Q8BSS9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppfia2Q8BSS9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppfia2Q8BSS9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppfia2Q8BSS9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfia2Q8BSS9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfia2Q8BSS9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfia2Q8BSS9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfia2Q8BSS9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppfia2Q8BSS9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfia2Q8BSS9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfia2Q8BSS9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfia2Q8BSS9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfia2Q8BSS9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfia2Q8BSS9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfia2Q8BSS9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfia2Q8BSS9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfia2Q8BSS9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppfia2Q8BSS9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ppfia2Q8BSS9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ppfia2Q8BSS9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfia2Q8BSS9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfia2Q8BSS9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfia2Q8BSS9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ppfia2Q8BSS9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ppfia2Q8BSS9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ppfia2Q8BSS9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ppfia2Q8BSS9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppfia2Q8BSS9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppfia2Q8BSS9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppfia2Q8BSS9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppfia2Q8BSS9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ppfia2Q8BSS9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms