Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf3c2Q8BL74 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf3c2Q8BL74 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf3c2Q8BL74 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gtf3c2Q8BL74 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf3c2Q8BL74 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gtf3c2Q8BL74 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c2Q8BL74 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gtf3c2Q8BL74 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf3c2Q8BL74 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf3c2Q8BL74 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf3c2Q8BL74 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf3c2Q8BL74 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf3c2Q8BL74 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf3c2Q8BL74 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gtf3c2Q8BL74 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf3c2Q8BL74 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf3c2Q8BL74 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf3c2Q8BL74 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gtf3c2Q8BL74 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtf3c2Q8BL74 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtf3c2Q8BL74 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c2Q8BL74 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c2Q8BL74 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf3c2Q8BL74 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf3c2Q8BL74 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf3c2Q8BL74 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gtf3c2Q8BL74 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c2Q8BL74 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c2Q8BL74 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf3c2Q8BL74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf3c2Q8BL74 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf3c2Q8BL74 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf3c2Q8BL74 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf3c2Q8BL74 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf3c2Q8BL74 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c2Q8BL74 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c2Q8BL74 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf3c2Q8BL74 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gtf3c2Q8BL74 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf3c2Q8BL74 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c2Q8BL74 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf3c2Q8BL74 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf3c2Q8BL74 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf3c2Q8BL74 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf3c2Q8BL74 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf3c2Q8BL74 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gtf3c2Q8BL74 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf3c2Q8BL74 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf3c2Q8BL74 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf3c2Q8BL74 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c2Q8BL74 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c2Q8BL74 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c2Q8BL74 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf3c2Q8BL74 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf3c2Q8BL74 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf3c2Q8BL74 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf3c2Q8BL74 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf3c2Q8BL74 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf3c2Q8BL74 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c2Q8BL74 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf3c2Q8BL74 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf3c2Q8BL74 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf3c2Q8BL74 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf3c2Q8BL74 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf3c2Q8BL74 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf3c2Q8BL74 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c2Q8BL74 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf3c2Q8BL74 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gtf3c2Q8BL74 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf3c2Q8BL74 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gtf3c2Q8BL74 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf3c2Q8BL74 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf3c2Q8BL74 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf3c2Q8BL74 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c2Q8BL74 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c2Q8BL74 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c2Q8BL74 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf3c2Q8BL74 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf3c2Q8BL74 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf3c2Q8BL74 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf3c2Q8BL74 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf3c2Q8BL74 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf3c2Q8BL74 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf3c2Q8BL74 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf3c2Q8BL74 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf3c2Q8BL74 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf3c2Q8BL74 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf3c2Q8BL74 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf3c2Q8BL74 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf3c2Q8BL74 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf3c2Q8BL74 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c2Q8BL74 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf3c2Q8BL74 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf3c2Q8BL74 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf3c2Q8BL74 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf3c2Q8BL74 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf3c2Q8BL74 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms