Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup93Q8BJ71 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup93Q8BJ71 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup93Q8BJ71 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup93Q8BJ71 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup93Q8BJ71 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup93Q8BJ71 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup93Q8BJ71 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup93Q8BJ71 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup93Q8BJ71 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup93Q8BJ71 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup93Q8BJ71 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup93Q8BJ71 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup93Q8BJ71 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup93Q8BJ71 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup93Q8BJ71 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nup93Q8BJ71 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup93Q8BJ71 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup93Q8BJ71 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup93Q8BJ71 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup93Q8BJ71 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup93Q8BJ71 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup93Q8BJ71 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup93Q8BJ71 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup93Q8BJ71 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nup93Q8BJ71 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nup93Q8BJ71 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nup93Q8BJ71 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup93Q8BJ71 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nup93Q8BJ71 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup93Q8BJ71 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nup93Q8BJ71 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nup93Q8BJ71 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nup93Q8BJ71 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Nup93Q8BJ71 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nup93Q8BJ71 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nup93Q8BJ71 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nup93Q8BJ71 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nup93Q8BJ71 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nup93Q8BJ71 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nup93Q8BJ71 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nup93Q8BJ71 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup93Q8BJ71 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nup93Q8BJ71 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nup93Q8BJ71 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nup93Q8BJ71 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nup93Q8BJ71 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nup93Q8BJ71 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nup93Q8BJ71 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Nup93Q8BJ71 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Nup93Q8BJ71 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup93Q8BJ71 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nup93Q8BJ71 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nup93Q8BJ71 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nup93Q8BJ71 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup93Q8BJ71 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nup93Q8BJ71 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup93Q8BJ71 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nup93Q8BJ71 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup93Q8BJ71 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup93Q8BJ71 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup93Q8BJ71 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup93Q8BJ71 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup93Q8BJ71 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup93Q8BJ71 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup93Q8BJ71 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nup93Q8BJ71 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup93Q8BJ71 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup93Q8BJ71 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup93Q8BJ71 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup93Q8BJ71 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup93Q8BJ71 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup93Q8BJ71 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup93Q8BJ71 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup93Q8BJ71 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup93Q8BJ71 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nup93Q8BJ71 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup93Q8BJ71 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nup93Q8BJ71 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nup93Q8BJ71 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nup93Q8BJ71 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nup93Q8BJ71 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup93Q8BJ71 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nup93Q8BJ71 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nup93Q8BJ71 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nup93Q8BJ71 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nup93Q8BJ71 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nup93Q8BJ71 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nup93Q8BJ71 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup93Q8BJ71 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nup93Q8BJ71 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nup93Q8BJ71 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms