Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
Cyp4f39Q8BGU0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Cyp4f39Q8BGU0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cyp4f39Q8BGU0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cyp4f39Q8BGU0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cyp4f39Q8BGU0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cyp4f39Q8BGU0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cyp4f39Q8BGU0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cyp4f39Q8BGU0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cyp4f39Q8BGU0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cyp4f39Q8BGU0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Cyp4f39Q8BGU0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cyp4f39Q8BGU0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cyp4f39Q8BGU0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cyp4f39Q8BGU0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cyp4f39Q8BGU0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cyp4f39Q8BGU0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cyp4f39Q8BGU0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cyp4f39Q8BGU0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cyp4f39Q8BGU0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cyp4f39Q8BGU0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cyp4f39Q8BGU0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cyp4f39Q8BGU0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cyp4f39Q8BGU0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cyp4f39Q8BGU0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cyp4f39Q8BGU0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cyp4f39Q8BGU0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cyp4f39Q8BGU0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cyp4f39Q8BGU0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Cyp4f39Q8BGU0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cyp4f39Q8BGU0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Cyp4f39Q8BGU0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cyp4f39Q8BGU0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cyp4f39Q8BGU0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cyp4f39Q8BGU0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cyp4f39Q8BGU0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cyp4f39Q8BGU0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cyp4f39Q8BGU0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cyp4f39Q8BGU0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cyp4f39Q8BGU0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cyp4f39Q8BGU0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cyp4f39Q8BGU0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cyp4f39Q8BGU0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cyp4f39Q8BGU0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Cyp4f39Q8BGU0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cyp4f39Q8BGU0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cyp4f39Q8BGU0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cyp4f39Q8BGU0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cyp4f39Q8BGU0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cyp4f39Q8BGU0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cyp4f39Q8BGU0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cyp4f39Q8BGU0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cyp4f39Q8BGU0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cyp4f39Q8BGU0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cyp4f39Q8BGU0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cyp4f39Q8BGU0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cyp4f39Q8BGU0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cyp4f39Q8BGU0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cyp4f39Q8BGU0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Cyp4f39Q8BGU0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cyp4f39Q8BGU0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cyp4f39Q8BGU0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cyp4f39Q8BGU0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cyp4f39Q8BGU0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms