Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Smndc1Q8BGT7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smndc1Q8BGT7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smndc1Q8BGT7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smndc1Q8BGT7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smndc1Q8BGT7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smndc1Q8BGT7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smndc1Q8BGT7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smndc1Q8BGT7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smndc1Q8BGT7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smndc1Q8BGT7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smndc1Q8BGT7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smndc1Q8BGT7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smndc1Q8BGT7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smndc1Q8BGT7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smndc1Q8BGT7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smndc1Q8BGT7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smndc1Q8BGT7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smndc1Q8BGT7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smndc1Q8BGT7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smndc1Q8BGT7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smndc1Q8BGT7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smndc1Q8BGT7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smndc1Q8BGT7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smndc1Q8BGT7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smndc1Q8BGT7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smndc1Q8BGT7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smndc1Q8BGT7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smndc1Q8BGT7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smndc1Q8BGT7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smndc1Q8BGT7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smndc1Q8BGT7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smndc1Q8BGT7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smndc1Q8BGT7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smndc1Q8BGT7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smndc1Q8BGT7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smndc1Q8BGT7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Smndc1Q8BGT7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smndc1Q8BGT7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smndc1Q8BGT7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smndc1Q8BGT7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smndc1Q8BGT7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smndc1Q8BGT7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smndc1Q8BGT7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smndc1Q8BGT7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smndc1Q8BGT7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smndc1Q8BGT7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smndc1Q8BGT7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smndc1Q8BGT7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smndc1Q8BGT7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smndc1Q8BGT7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smndc1Q8BGT7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smndc1Q8BGT7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smndc1Q8BGT7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smndc1Q8BGT7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smndc1Q8BGT7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smndc1Q8BGT7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smndc1Q8BGT7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smndc1Q8BGT7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smndc1Q8BGT7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smndc1Q8BGT7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smndc1Q8BGT7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smndc1Q8BGT7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smndc1Q8BGT7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smndc1Q8BGT7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smndc1Q8BGT7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smndc1Q8BGT7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smndc1Q8BGT7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smndc1Q8BGT7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smndc1Q8BGT7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smndc1Q8BGT7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smndc1Q8BGT7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smndc1Q8BGT7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smndc1Q8BGT7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smndc1Q8BGT7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smndc1Q8BGT7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smndc1Q8BGT7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smndc1Q8BGT7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smndc1Q8BGT7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms