Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Htatsf1Q8BGC0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Htatsf1Q8BGC0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Htatsf1Q8BGC0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Htatsf1Q8BGC0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Htatsf1Q8BGC0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Htatsf1Q8BGC0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Htatsf1Q8BGC0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Htatsf1Q8BGC0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Htatsf1Q8BGC0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Htatsf1Q8BGC0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Htatsf1Q8BGC0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Htatsf1Q8BGC0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Htatsf1Q8BGC0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Htatsf1Q8BGC0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Htatsf1Q8BGC0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Htatsf1Q8BGC0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Htatsf1Q8BGC0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Htatsf1Q8BGC0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Htatsf1Q8BGC0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Htatsf1Q8BGC0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Htatsf1Q8BGC0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Htatsf1Q8BGC0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Htatsf1Q8BGC0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Htatsf1Q8BGC0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Htatsf1Q8BGC0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Htatsf1Q8BGC0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Htatsf1Q8BGC0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Htatsf1Q8BGC0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Htatsf1Q8BGC0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Htatsf1Q8BGC0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Htatsf1Q8BGC0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Htatsf1Q8BGC0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Htatsf1Q8BGC0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Htatsf1Q8BGC0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Htatsf1Q8BGC0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Htatsf1Q8BGC0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Htatsf1Q8BGC0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Htatsf1Q8BGC0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Htatsf1Q8BGC0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Htatsf1Q8BGC0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Htatsf1Q8BGC0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Htatsf1Q8BGC0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Htatsf1Q8BGC0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Htatsf1Q8BGC0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Htatsf1Q8BGC0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Htatsf1Q8BGC0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Htatsf1Q8BGC0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Htatsf1Q8BGC0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Htatsf1Q8BGC0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Htatsf1Q8BGC0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Htatsf1Q8BGC0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Htatsf1Q8BGC0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Htatsf1Q8BGC0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Htatsf1Q8BGC0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Htatsf1Q8BGC0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Htatsf1Q8BGC0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Htatsf1Q8BGC0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Htatsf1Q8BGC0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Htatsf1Q8BGC0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Htatsf1Q8BGC0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Htatsf1Q8BGC0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Htatsf1Q8BGC0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Htatsf1Q8BGC0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Htatsf1Q8BGC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Htatsf1Q8BGC0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Htatsf1Q8BGC0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Htatsf1Q8BGC0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Htatsf1Q8BGC0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Htatsf1Q8BGC0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Htatsf1Q8BGC0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Htatsf1Q8BGC0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Htatsf1Q8BGC0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Htatsf1Q8BGC0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Htatsf1Q8BGC0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Htatsf1Q8BGC0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Htatsf1Q8BGC0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Htatsf1Q8BGC0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Htatsf1Q8BGC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Htatsf1Q8BGC0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Htatsf1Q8BGC0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Htatsf1Q8BGC0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Htatsf1Q8BGC0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Htatsf1Q8BGC0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Htatsf1Q8BGC0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Htatsf1Q8BGC0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Htatsf1Q8BGC0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Htatsf1Q8BGC0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Htatsf1Q8BGC0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Htatsf1Q8BGC0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Htatsf1Q8BGC0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Htatsf1Q8BGC0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Htatsf1Q8BGC0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms