Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc181Q80ZU5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc181Q80ZU5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc181Q80ZU5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc181Q80ZU5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc181Q80ZU5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc181Q80ZU5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc181Q80ZU5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc181Q80ZU5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc181Q80ZU5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc181Q80ZU5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc181Q80ZU5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc181Q80ZU5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc181Q80ZU5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc181Q80ZU5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc181Q80ZU5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc181Q80ZU5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc181Q80ZU5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc181Q80ZU5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc181Q80ZU5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc181Q80ZU5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc181Q80ZU5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc181Q80ZU5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc181Q80ZU5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc181Q80ZU5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc181Q80ZU5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc181Q80ZU5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc181Q80ZU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc181Q80ZU5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc181Q80ZU5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc181Q80ZU5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc181Q80ZU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc181Q80ZU5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc181Q80ZU5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms