Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc181Q80ZU5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc181Q80ZU5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc181Q80ZU5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc181Q80ZU5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc181Q80ZU5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc181Q80ZU5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc181Q80ZU5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc181Q80ZU5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc181Q80ZU5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc181Q80ZU5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc181Q80ZU5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc181Q80ZU5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc181Q80ZU5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc181Q80ZU5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc181Q80ZU5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc181Q80ZU5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc181Q80ZU5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc181Q80ZU5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc181Q80ZU5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc181Q80ZU5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc181Q80ZU5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc181Q80ZU5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc181Q80ZU5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc181Q80ZU5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc181Q80ZU5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc181Q80ZU5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc181Q80ZU5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc181Q80ZU5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc181Q80ZU5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc181Q80ZU5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc181Q80ZU5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc181Q80ZU5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc181Q80ZU5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc181Q80ZU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc181Q80ZU5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc181Q80ZU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc181Q80ZU5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc181Q80ZU5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc181Q80ZU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc181Q80ZU5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc181Q80ZU5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc181Q80ZU5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc181Q80ZU5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc181Q80ZU5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms